More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4898 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  100 
 
 		 489 aa  966    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  68.97 
 
 		 506 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  62.32 
 
 		 496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  29.09 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.31 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  29.09 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  28.82 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  28.63 
 
 		 463 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  28.76 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.65 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.89 
 
 		 474 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.35 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.19 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.72 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 472 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  28.26 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 459 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.31 
 
 		 484 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  26.28 
 
 		 498 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  24.85 
 
 		 492 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.64 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.11 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.42 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.59 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.91 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  27.46 
 
 		 508 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 638 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.95 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.71 
 
 		 523 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.94 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.14 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.94 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.14 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.14 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  31.07 
 
 		 463 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.14 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  28.01 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.83 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.94 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.75 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  28.4 
 
 		 538 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.8 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.94 
 
 		 482 aa  99.8  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.94 
 
 		 492 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.95 
 
 		 598 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.3 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  25.49 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.43 
 
 		 504 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.49 
 
 		 496 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.91 
 
 		 493 aa  97.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  25.23 
 
 		 489 aa  97.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  26.1 
 
 		 502 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  26.1 
 
 		 502 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  26.1 
 
 		 502 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  28.01 
 
 		 498 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  26.1 
 
 		 502 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.68 
 
 		 489 aa  97.1  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.68 
 
 		 533 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.69 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  26.76 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  25.45 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.42 
 
 		 485 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 502 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.15 
 
 		 542 aa  95.1  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  25.9 
 
 		 503 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.33 
 
 		 500 aa  94  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  22.86 
 
 		 524 aa  93.6  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.82 
 
 		 506 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  24.42 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.21 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  24.46 
 
 		 544 aa  92  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.74 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  25 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.99 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.15 
 
 		 533 aa  90.9  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.2 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  24.42 
 
 		 462 aa  90.9  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  22.48 
 
 		 486 aa  90.5  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  25.75 
 
 		 488 aa  90.1  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  24.7 
 
 		 499 aa  90.5  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27.12 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  26.08 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  24.4 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  22.11 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  24.03 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  23.27 
 
 		 518 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  25.4 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  24.5 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  27.02 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  24.88 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  22.36 
 
 		 483 aa  88.6  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.06 
 
 		 539 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  24.5 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  24.5 
 
 		 502 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  25.45 
 
 		 529 aa  87.8  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  25.68 
 
 		 497 aa  87.8  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>