184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0686 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  100 
 
 
507 aa  974    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  37.45 
 
 
483 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50012  predicted protein  31.46 
 
 
578 aa  167  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0346836  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24399  SSS family transporter: sodium ion/solute  28.64 
 
 
577 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  29.36 
 
 
556 aa  107  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60304  urea transport protein  25.54 
 
 
520 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.087993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  26.01 
 
 
587 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  27.31 
 
 
476 aa  91.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  26.21 
 
 
474 aa  87  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.68 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  24.66 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  27 
 
 
478 aa  77  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  24.25 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  29.61 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.25 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  24.02 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  24.14 
 
 
679 aa  70.1  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  28.65 
 
 
551 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  25.66 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.76 
 
 
476 aa  67.4  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  26.96 
 
 
482 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  24.24 
 
 
633 aa  65.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  25.41 
 
 
639 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.78 
 
 
483 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.91 
 
 
459 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  27.57 
 
 
492 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.91 
 
 
459 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.82 
 
 
484 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  25.82 
 
 
483 aa  61.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  23.38 
 
 
483 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  21.46 
 
 
668 aa  61.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  23.38 
 
 
483 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  25.52 
 
 
483 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  26.02 
 
 
473 aa  60.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  24.51 
 
 
483 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  24.51 
 
 
483 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  23.13 
 
 
500 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  25.82 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  25.82 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  23.15 
 
 
483 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  26.1 
 
 
509 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.71 
 
 
474 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  25.82 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  23.15 
 
 
483 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  25.82 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  25.82 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  25.82 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  25.82 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  22.74 
 
 
668 aa  60.1  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  22.92 
 
 
483 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  27.57 
 
 
495 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0697  hypothetical protein  23.22 
 
 
953 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26.25 
 
 
638 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  27.15 
 
 
564 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25.68 
 
 
513 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.15 
 
 
526 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.95 
 
 
493 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  24.4 
 
 
462 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  29.48 
 
 
524 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0355  hypothetical protein  26.7 
 
 
1111 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  24.52 
 
 
488 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  22.3 
 
 
556 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  27.92 
 
 
491 aa  57.4  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  29.91 
 
 
494 aa  57  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0694  hypothetical protein  24.24 
 
 
958 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  30.04 
 
 
494 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  28.88 
 
 
494 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  25.76 
 
 
509 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  27.59 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  23.31 
 
 
674 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  23.03 
 
 
527 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.7 
 
 
506 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  24.43 
 
 
477 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.83 
 
 
565 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  25.75 
 
 
481 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  21.88 
 
 
484 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  21.88 
 
 
484 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  21.88 
 
 
484 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.61 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  24.23 
 
 
477 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.39 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  27.34 
 
 
488 aa  54.3  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.39 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.39 
 
 
492 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.39 
 
 
492 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  21.63 
 
 
474 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.39 
 
 
492 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  24.81 
 
 
479 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  24.81 
 
 
479 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.44 
 
 
492 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.51 
 
 
496 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  26.53 
 
 
540 aa  53.9  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  24.81 
 
 
479 aa  53.5  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  24.81 
 
 
479 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  24.12 
 
 
477 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  24.81 
 
 
479 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  25.63 
 
 
483 aa  53.5  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  26.68 
 
 
494 aa  53.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>