16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24399 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_24399  SSS family transporter: sodium ion/solute  100 
 
 		 577 aa  1169    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50012  predicted protein  41.49 
 
 		 578 aa  361  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0346836  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  28.39 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60304  urea transport protein  26.26 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.087993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  27.41 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.25 
 
 		 489 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  23.92 
 
 		 489 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  23.92 
 
 		 489 aa  50.4  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  24.31 
 
 		 474 aa  48.5  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  22.51 
 
 		 520 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.33 
 
 		 482 aa  47  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 638 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  23.92 
 
 		 498 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.6 
 
 		 523 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.19 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  24.37 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>