More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1541 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  100 
 
 
524 aa  1022    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  63.62 
 
 
492 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  64.13 
 
 
494 aa  571  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  64.27 
 
 
494 aa  565  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  60.34 
 
 
494 aa  529  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  32.71 
 
 
474 aa  210  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  32.37 
 
 
479 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  30.73 
 
 
507 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  29.94 
 
 
489 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  27.59 
 
 
495 aa  130  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  29.39 
 
 
491 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  27 
 
 
494 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  27.7 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  27.7 
 
 
483 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  27.78 
 
 
483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  27.78 
 
 
483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  27.59 
 
 
483 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  27.03 
 
 
483 aa  116  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  27.84 
 
 
483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  30.54 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.61 
 
 
483 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  26.2 
 
 
487 aa  115  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  27.25 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  31.16 
 
 
484 aa  113  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  31.16 
 
 
484 aa  113  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  31.16 
 
 
484 aa  113  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  26.34 
 
 
503 aa  113  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  26.48 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  27.55 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  23.33 
 
 
482 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  26.48 
 
 
540 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.26 
 
 
492 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  27.16 
 
 
477 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  27.01 
 
 
483 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  25.27 
 
 
492 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  26.79 
 
 
483 aa  103  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  27.21 
 
 
477 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  27 
 
 
477 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  27 
 
 
477 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  26.83 
 
 
477 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  26.78 
 
 
486 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 
479 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 
479 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 
479 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 
479 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 
479 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  25.44 
 
 
486 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  25.27 
 
 
490 aa  100  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  25.14 
 
 
490 aa  100  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  24.79 
 
 
490 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  25.62 
 
 
492 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  26.54 
 
 
486 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  25 
 
 
496 aa  99.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  26.09 
 
 
486 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  27.43 
 
 
477 aa  97.8  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  24.46 
 
 
464 aa  97.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  26.37 
 
 
490 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  25.3 
 
 
490 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  25.3 
 
 
490 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  25 
 
 
490 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  25.36 
 
 
490 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26754  SSS family transporter: sodium ion/pantothenate  27.03 
 
 
623 aa  94.7  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.293152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  25 
 
 
490 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  25.06 
 
 
490 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  25 
 
 
490 aa  94.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  25.07 
 
 
490 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  25.07 
 
 
490 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  22.94 
 
 
490 aa  93.6  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  25.44 
 
 
464 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  25.68 
 
 
490 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25.58 
 
 
513 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  25.99 
 
 
512 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  24.01 
 
 
492 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0671  Na+/solute symporter  33.33 
 
 
701 aa  87  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1899  Na+/solute symporter  31.22 
 
 
763 aa  87  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  21.69 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  24.53 
 
 
486 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.31 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  24.35 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.45 
 
 
518 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.72 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  23.12 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2003  Na+/solute symporter  30.93 
 
 
724 aa  84.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.357117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  29.13 
 
 
546 aa  84  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  24.3 
 
 
543 aa  84  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  28.53 
 
 
528 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.61 
 
 
484 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  25.82 
 
 
516 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  29.54 
 
 
460 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  26.63 
 
 
516 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  28.17 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  28.18 
 
 
483 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.74 
 
 
533 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>