More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4426 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  95.26 
 
 		 486 aa  875    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  100 
 
 		 486 aa  950    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  71.06 
 
 		 486 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  99.18 
 
 		 486 aa  944    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  66.24 
 
 		 490 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  64.89 
 
 		 492 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  61.62 
 
 		 490 aa  594  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  61.62 
 
 		 490 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  61.62 
 
 		 490 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  61.4 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  61.62 
 
 		 490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  61.62 
 
 		 490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  65.33 
 
 		 490 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  62.85 
 
 		 490 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  61.4 
 
 		 490 aa  580  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  61.4 
 
 		 490 aa  578  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  58.58 
 
 		 490 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  63.07 
 
 		 490 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  60.96 
 
 		 490 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  61.62 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  59.7 
 
 		 486 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  50 
 
 		 492 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  50.62 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  50.41 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  47.68 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  47.68 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  47.68 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  48.05 
 
 		 517 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  43.95 
 
 		 490 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  36.59 
 
 		 495 aa  273  7e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  33.75 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  32.98 
 
 		 507 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  35.32 
 
 		 489 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  31.32 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  31.86 
 
 		 516 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  32.31 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  32.31 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  32.31 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  31.36 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  32.31 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  32.31 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  32.31 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  31.12 
 
 		 491 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  31.46 
 
 		 516 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  29.46 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  31.46 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  31.85 
 
 		 516 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  31.85 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  31.22 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  31.22 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  31.22 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  30.05 
 
 		 503 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  30.75 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  29.88 
 
 		 493 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  31.17 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  31.17 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  31.17 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  32.27 
 
 		 516 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  29.4 
 
 		 493 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  31.46 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  30.42 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  29.56 
 
 		 460 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  30.43 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  28.52 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 572 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  29.4 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  28.74 
 
 		 549 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  29.37 
 
 		 509 aa  158  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  30.05 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  30.06 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  29.69 
 
 		 546 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  29.29 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  27.95 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  28.68 
 
 		 500 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  30.7 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  28.72 
 
 		 498 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  28.03 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  27.95 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  28.14 
 
 		 491 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  28.57 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  27.95 
 
 		 529 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  28.83 
 
 		 491 aa  129  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  25.15 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  29.35 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  25.8 
 
 		 520 aa  124  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 460 aa  124  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  29.89 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  30.07 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3350  Na+/solute symporter  27.94 
 
 		 497 aa  106  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  24.84 
 
 		 492 aa  93.6  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 524 aa  93.2  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  24.02 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  24.27 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  24.46 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  26.4 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.02 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  24.93 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.35 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>