135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0758 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  100 
 
 
460 aa  906    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  47.98 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  47.06 
 
 
460 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  46.68 
 
 
461 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  45.85 
 
 
460 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  45.79 
 
 
464 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  48.41 
 
 
461 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  47.81 
 
 
463 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  27.84 
 
 
486 aa  136  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  28.47 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  27.1 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  26.06 
 
 
495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  26.6 
 
 
492 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  27.61 
 
 
486 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  27.27 
 
 
500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  26.4 
 
 
500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  27.45 
 
 
492 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  27.21 
 
 
486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  26.99 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  24.81 
 
 
490 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  25.16 
 
 
490 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  25.17 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  27.09 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  26.93 
 
 
490 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  24.81 
 
 
490 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  26.65 
 
 
490 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  24.57 
 
 
490 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  25.06 
 
 
490 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  25.06 
 
 
490 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  24.11 
 
 
490 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  24.83 
 
 
490 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  24.83 
 
 
490 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  26 
 
 
502 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  26 
 
 
502 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  24.6 
 
 
490 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  24.76 
 
 
490 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  23.84 
 
 
490 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  25.85 
 
 
490 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.67 
 
 
516 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  26.67 
 
 
516 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  26.67 
 
 
516 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.67 
 
 
516 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  26.67 
 
 
516 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.67 
 
 
516 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.67 
 
 
516 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  26.01 
 
 
516 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  27.46 
 
 
491 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  26.59 
 
 
498 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  26.45 
 
 
516 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  26.45 
 
 
516 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  26.45 
 
 
516 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  26.45 
 
 
516 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  26.45 
 
 
516 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  24.86 
 
 
503 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  26.45 
 
 
516 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  23.82 
 
 
547 aa  96.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  22.93 
 
 
486 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  24.4 
 
 
507 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  27.33 
 
 
493 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.73 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.73 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  27.33 
 
 
493 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  25.76 
 
 
491 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  24.88 
 
 
491 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  26.64 
 
 
517 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  26.56 
 
 
509 aa  91.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  25 
 
 
516 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  25.34 
 
 
516 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  24.33 
 
 
491 aa  90.5  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  25.07 
 
 
516 aa  90.5  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  22.6 
 
 
492 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  25.74 
 
 
527 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  25.2 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  26.23 
 
 
549 aa  84  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  25.98 
 
 
572 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  26.01 
 
 
546 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  23.68 
 
 
488 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  29.15 
 
 
515 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  24.41 
 
 
554 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  24.22 
 
 
529 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  26.39 
 
 
507 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  30.99 
 
 
506 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  23.67 
 
 
491 aa  63.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  22.15 
 
 
520 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  21.52 
 
 
508 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  22.22 
 
 
530 aa  61.6  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  25.64 
 
 
525 aa  60.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.05 
 
 
524 aa  60.1  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  23.15 
 
 
492 aa  59.7  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  23.41 
 
 
494 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  22.37 
 
 
494 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  20.65 
 
 
492 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  23.01 
 
 
503 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  18 
 
 
474 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1899  Na+/solute symporter  26.4 
 
 
763 aa  51.2  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  22.51 
 
 
512 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0671  Na+/solute symporter  26.06 
 
 
701 aa  50.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  21.86 
 
 
489 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  23.72 
 
 
494 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  22.49 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>