262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0555 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  100 
 
 
488 aa  936    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  38.68 
 
 
516 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  38.68 
 
 
516 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  36.58 
 
 
516 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  38.68 
 
 
516 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  38.24 
 
 
516 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  36.9 
 
 
516 aa  289  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  38.22 
 
 
516 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  38.22 
 
 
516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  37.83 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  37.83 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  38.14 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  37.83 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  37.83 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  37.83 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  37.83 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  36.34 
 
 
503 aa  282  8.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  37.06 
 
 
554 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  38.31 
 
 
516 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  38.31 
 
 
516 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  36.87 
 
 
516 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  34.63 
 
 
547 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  35.14 
 
 
549 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  33.74 
 
 
500 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  34.4 
 
 
509 aa  269  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  34.53 
 
 
491 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  33.68 
 
 
502 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  33.68 
 
 
502 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  36.19 
 
 
498 aa  253  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  33.69 
 
 
493 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  35.19 
 
 
507 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  36.21 
 
 
546 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  31.99 
 
 
530 aa  246  6.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  33.77 
 
 
493 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  36.45 
 
 
500 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  35.19 
 
 
491 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  33.65 
 
 
527 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  34.59 
 
 
572 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  36.83 
 
 
491 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  33.92 
 
 
520 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  35.98 
 
 
529 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  36.26 
 
 
491 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  32.7 
 
 
526 aa  226  7e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  32.91 
 
 
492 aa  224  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  35.03 
 
 
515 aa  196  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  34.07 
 
 
506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  29.19 
 
 
486 aa  177  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  28.05 
 
 
492 aa  166  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  29.75 
 
 
495 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  26.12 
 
 
490 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  26.53 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  27.59 
 
 
507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  25.3 
 
 
492 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  26.6 
 
 
492 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  26.12 
 
 
490 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  26.55 
 
 
490 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  26.11 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  26.07 
 
 
490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  26.07 
 
 
490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  26.07 
 
 
490 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  26.07 
 
 
490 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  28.89 
 
 
486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  24.95 
 
 
492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  26.03 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  26.07 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  28.64 
 
 
486 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  25.85 
 
 
490 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  30.12 
 
 
486 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  26.07 
 
 
490 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  28.1 
 
 
490 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  27.63 
 
 
490 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  25.96 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  24 
 
 
490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  23.6 
 
 
498 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  25.68 
 
 
517 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  22.77 
 
 
464 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  22.98 
 
 
460 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  22.99 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  22.3 
 
 
461 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  23.84 
 
 
464 aa  96.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.9 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  26.43 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.9 
 
 
486 aa  95.1  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  23.49 
 
 
492 aa  90.9  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  25.05 
 
 
503 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  21.59 
 
 
474 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  23 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  23.79 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  23.3 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  26.46 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  24.88 
 
 
494 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  23.33 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.75 
 
 
491 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.93 
 
 
524 aa  67.4  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  24.49 
 
 
494 aa  67  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.49 
 
 
493 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.49 
 
 
492 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.07 
 
 
492 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.07 
 
 
493 aa  63.9  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.07 
 
 
493 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>