185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3558 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  74.55 
 
 		 460 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  76.5 
 
 		 463 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  73.42 
 
 		 461 aa  695    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  100 
 
 		 461 aa  915    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  73.39 
 
 		 460 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  69.89 
 
 		 464 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  67.78 
 
 		 464 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  48 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  27.92 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  29.2 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  29.93 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  26.95 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  31.33 
 
 		 486 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  31.33 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  26.74 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  28.51 
 
 		 490 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  29.72 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  27.45 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  26.74 
 
 		 490 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  27.75 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  26.74 
 
 		 490 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  26.74 
 
 		 490 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  26.52 
 
 		 490 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  26.52 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  26.09 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  26.09 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  26.3 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 492 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  27.61 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  27.92 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  29.48 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  27.42 
 
 		 490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  25.93 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  26.3 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  27.21 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  26.76 
 
 		 493 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 490 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  27.58 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  27.18 
 
 		 517 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  23.78 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  26.97 
 
 		 491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  26.42 
 
 		 498 aa  116  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  24.58 
 
 		 507 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  27.87 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  25.65 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 572 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.4 
 
 		 516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.59 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.59 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  26.28 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  26.35 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  23.59 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  27.4 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  27.4 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.4 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  27.4 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.4 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.4 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  24.72 
 
 		 547 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  22.89 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  22.64 
 
 		 500 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  24.47 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  24.29 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 509 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  24.56 
 
 		 516 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  24.56 
 
 		 516 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  24.72 
 
 		 516 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  24.67 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 516 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  24.29 
 
 		 516 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  23.76 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  25.54 
 
 		 520 aa  99.8  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  24.51 
 
 		 516 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  25.58 
 
 		 516 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  24.79 
 
 		 554 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  24.43 
 
 		 546 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  24.79 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  23.32 
 
 		 549 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  24.12 
 
 		 488 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  29.02 
 
 		 515 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  23.37 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  23.36 
 
 		 530 aa  83.2  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.65 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  24.14 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  22.03 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  33.33 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  26.37 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  21.05 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  23.88 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.41 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  23.74 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 492 aa  67  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1899  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 763 aa  66.6  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  23.46 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  23.57 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  22.8 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0047  Na+/solute symporter  24.59 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>