More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1295 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  100 
 
 
490 aa  972    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  85.1 
 
 
492 aa  800    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  97.14 
 
 
490 aa  932    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  65.08 
 
 
490 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  67.75 
 
 
490 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  63.85 
 
 
490 aa  618  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  63.85 
 
 
490 aa  618  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  67.53 
 
 
490 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  64.18 
 
 
490 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  63.85 
 
 
490 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  63.64 
 
 
490 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  61.65 
 
 
490 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  64.1 
 
 
490 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  63.64 
 
 
490 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  63.21 
 
 
490 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  66.18 
 
 
486 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  63.85 
 
 
490 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  65.96 
 
 
486 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  65.72 
 
 
486 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  65.94 
 
 
486 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  64.43 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  53.46 
 
 
492 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  49.68 
 
 
492 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  48.45 
 
 
486 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  48.45 
 
 
486 aa  477  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  48.45 
 
 
486 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  49.16 
 
 
492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  51.33 
 
 
517 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  44.24 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  38.02 
 
 
495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  33.74 
 
 
507 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  34 
 
 
489 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  31.42 
 
 
498 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  31.79 
 
 
503 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  29.77 
 
 
516 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.75 
 
 
516 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  29.75 
 
 
516 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  29.75 
 
 
516 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  29.75 
 
 
516 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  29.16 
 
 
516 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.75 
 
 
516 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  30 
 
 
516 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.75 
 
 
516 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  29.07 
 
 
516 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  29.07 
 
 
516 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  29.07 
 
 
516 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  28.2 
 
 
547 aa  171  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  29.53 
 
 
516 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  28.81 
 
 
503 aa  170  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  29.31 
 
 
500 aa  170  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  29.07 
 
 
516 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  29.57 
 
 
516 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  29.57 
 
 
516 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  28.45 
 
 
554 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  28.84 
 
 
516 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  29.37 
 
 
516 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  29.2 
 
 
491 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  28.72 
 
 
460 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  27.25 
 
 
509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  28.95 
 
 
572 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  27.12 
 
 
464 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  28.23 
 
 
493 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  28.85 
 
 
460 aa  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  28.32 
 
 
493 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  27.07 
 
 
461 aa  153  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  26.32 
 
 
488 aa  153  8.999999999999999e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  29.97 
 
 
546 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  30.56 
 
 
527 aa  151  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  29.28 
 
 
464 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  28.94 
 
 
549 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  24.49 
 
 
492 aa  143  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  29.28 
 
 
498 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  28.11 
 
 
502 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  28.11 
 
 
502 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  27.02 
 
 
507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  29.4 
 
 
491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  29.2 
 
 
491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  29.93 
 
 
491 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  27.83 
 
 
529 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  27.58 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  26.86 
 
 
530 aa  129  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  25.61 
 
 
520 aa  124  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  29.75 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  31.4 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  24.65 
 
 
526 aa  117  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  26.15 
 
 
492 aa  113  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  26.75 
 
 
463 aa  113  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  26.54 
 
 
460 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  28.05 
 
 
494 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  27.95 
 
 
506 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  28.17 
 
 
484 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0047  Na+/solute symporter  22.84 
 
 
508 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  25.36 
 
 
494 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.01 
 
 
492 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  23.03 
 
 
509 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  23.19 
 
 
509 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  23.95 
 
 
524 aa  91.3  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  22.69 
 
 
474 aa  90.5  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.01 
 
 
492 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.01 
 
 
492 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>