More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2736 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  100 
 
 
498 aa  959    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  35.1 
 
 
486 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  34.12 
 
 
486 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  33.55 
 
 
486 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  33.33 
 
 
486 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  29.57 
 
 
490 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  29.87 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  32.69 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  29.87 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  32.86 
 
 
490 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  29.65 
 
 
490 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  29.65 
 
 
490 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  29.65 
 
 
490 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  33.33 
 
 
486 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  29.22 
 
 
490 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  31.23 
 
 
490 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  29 
 
 
490 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  31.75 
 
 
492 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  29.78 
 
 
490 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  29.35 
 
 
490 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  29.13 
 
 
490 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  31.21 
 
 
490 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  32.78 
 
 
492 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  31.42 
 
 
490 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  31.78 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  30.17 
 
 
492 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  31.04 
 
 
495 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  33.19 
 
 
517 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.11 
 
 
486 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.11 
 
 
486 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  27.9 
 
 
486 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  29.03 
 
 
507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  28.67 
 
 
500 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  28.1 
 
 
491 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  28.12 
 
 
460 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  27.78 
 
 
493 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  27.57 
 
 
493 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  28.39 
 
 
507 aa  140  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  29.25 
 
 
498 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  30.68 
 
 
502 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  30.68 
 
 
502 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  25.88 
 
 
461 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  28.13 
 
 
464 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  29.66 
 
 
546 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  27.46 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  28.83 
 
 
529 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  27.58 
 
 
461 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  28.17 
 
 
500 aa  124  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  27.67 
 
 
554 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  28.61 
 
 
503 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  27.29 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  28.07 
 
 
516 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  28.6 
 
 
516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  28.34 
 
 
516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  28.6 
 
 
516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  28.34 
 
 
516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  26.97 
 
 
509 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  28.27 
 
 
516 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.41 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  28.41 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  28.41 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.41 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  28.01 
 
 
527 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.41 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  28.41 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.41 
 
 
516 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  28.77 
 
 
516 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  28.53 
 
 
516 aa  117  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  28.31 
 
 
491 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  27.15 
 
 
516 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  23.8 
 
 
488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  26.7 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  27.68 
 
 
572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  27.48 
 
 
549 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  28.37 
 
 
516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  27.06 
 
 
491 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  27.36 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  26.43 
 
 
547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  27.16 
 
 
491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  26.15 
 
 
526 aa  110  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  26.33 
 
 
463 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  26.19 
 
 
503 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  25.11 
 
 
530 aa  107  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  27.41 
 
 
492 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  26.59 
 
 
460 aa  97.8  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  25.49 
 
 
520 aa  97.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  26.92 
 
 
515 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  27.52 
 
 
494 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  28.53 
 
 
506 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.7 
 
 
491 aa  87.8  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  27.82 
 
 
494 aa  87  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3350  Na+/solute symporter  24.95 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  26.64 
 
 
494 aa  84  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  23.16 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.44 
 
 
524 aa  77  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  24.28 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  25.72 
 
 
513 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  24.88 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  23.8 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  26.16 
 
 
515 aa  70.1  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>