More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1921 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  100 
 
 
546 aa  1085    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  70.83 
 
 
554 aa  739    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  68.17 
 
 
529 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  65.43 
 
 
549 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  58.32 
 
 
527 aa  569  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  55.78 
 
 
547 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  55.26 
 
 
516 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  54.48 
 
 
572 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.45 
 
 
516 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  55.32 
 
 
516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  56.05 
 
 
516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  54.89 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  54.94 
 
 
516 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  55.13 
 
 
516 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  55.13 
 
 
516 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.84 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  56.84 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  56.84 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.84 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.84 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  56.84 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  55.08 
 
 
516 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  51.05 
 
 
503 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  54.68 
 
 
516 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  53.74 
 
 
502 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  53.74 
 
 
502 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  54.72 
 
 
491 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  55.27 
 
 
516 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  52.9 
 
 
498 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  54.73 
 
 
516 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  56.86 
 
 
491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  49.61 
 
 
500 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  56.08 
 
 
491 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  48.65 
 
 
509 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  50 
 
 
493 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  50.82 
 
 
493 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  49.3 
 
 
491 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  48.79 
 
 
507 aa  418  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  47.46 
 
 
500 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  44.83 
 
 
515 aa  336  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  40.61 
 
 
526 aa  334  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  42.03 
 
 
530 aa  330  6e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  46.8 
 
 
506 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  38.84 
 
 
492 aa  301  3e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  43.04 
 
 
520 aa  300  5e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  34.58 
 
 
488 aa  266  5e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  28.26 
 
 
490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  29.58 
 
 
490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  26.92 
 
 
492 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  29.7 
 
 
490 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  29.55 
 
 
486 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  30.98 
 
 
490 aa  160  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  28.25 
 
 
490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  29.48 
 
 
486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  28.04 
 
 
490 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.16 
 
 
490 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  27.95 
 
 
490 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  27.95 
 
 
490 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  29.75 
 
 
486 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  28.64 
 
 
492 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  27.57 
 
 
490 aa  153  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  29.21 
 
 
490 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  28.04 
 
 
490 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  29 
 
 
486 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  27.44 
 
 
490 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  29.54 
 
 
492 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  29.02 
 
 
490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  28.64 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  27.33 
 
 
490 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  28.22 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  29.66 
 
 
498 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  30.67 
 
 
492 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  26.13 
 
 
517 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.96 
 
 
486 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.96 
 
 
486 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  26.35 
 
 
495 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  25.96 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  27.53 
 
 
464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  28.37 
 
 
464 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  25.58 
 
 
460 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  25.51 
 
 
461 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  24.46 
 
 
460 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  25.62 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  23.81 
 
 
507 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  24.89 
 
 
492 aa  88.2  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  24.65 
 
 
503 aa  87  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  24.32 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  28.77 
 
 
524 aa  83.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  25.43 
 
 
460 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.99 
 
 
491 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  27.08 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  21.68 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.83 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  25.06 
 
 
494 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  22.96 
 
 
552 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  23.19 
 
 
513 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  23.97 
 
 
552 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  22.91 
 
 
549 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  22.47 
 
 
516 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  22.69 
 
 
549 aa  67  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>