283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5820 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  84.73 
 
 		 491 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  84.73 
 
 		 491 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  100 
 
 		 491 aa  959    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  71.66 
 
 		 502 aa  669    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  76.34 
 
 		 498 aa  701    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  71.66 
 
 		 502 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  62.8 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  64.21 
 
 		 491 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  64.77 
 
 		 493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  64.15 
 
 		 493 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  54.72 
 
 		 554 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  57.2 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  57.31 
 
 		 507 aa  508  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  58.23 
 
 		 527 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  54.26 
 
 		 549 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  55.97 
 
 		 546 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  56.7 
 
 		 516 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  54.17 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  57.17 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  56.47 
 
 		 516 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  51.67 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  56.28 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  53.65 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  56.05 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  56.05 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  53.31 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  56.49 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  56.49 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.49 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  56.49 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.49 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.49 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  56.82 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  56.25 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  55.58 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  55.81 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  52.57 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  49.59 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  48.67 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  46.52 
 
 		 506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  45.76 
 
 		 515 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  40 
 
 		 530 aa  312  1e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  37.01 
 
 		 526 aa  289  7e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  36.18 
 
 		 488 aa  286  4e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  37.97 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  34.35 
 
 		 492 aa  256  4e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  31.13 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  30.77 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  29.52 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  30.49 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  25.31 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  29.19 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  28.98 
 
 		 490 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  27.72 
 
 		 490 aa  150  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  28.04 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  26.57 
 
 		 461 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  28.96 
 
 		 486 aa  147  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  28.18 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  29.06 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  30.68 
 
 		 490 aa  146  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  28.48 
 
 		 490 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  28.63 
 
 		 490 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  28.63 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  28.63 
 
 		 490 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  28.57 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  26.83 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.41 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  29.02 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  27.94 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  27.71 
 
 		 486 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  29.03 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  28.51 
 
 		 490 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  28.8 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  28.61 
 
 		 492 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  27.81 
 
 		 498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  25.96 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.36 
 
 		 495 aa  123  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  27.33 
 
 		 517 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.64 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  26.64 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.64 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  27.4 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  24.33 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.85 
 
 		 492 aa  90.5  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  26.92 
 
 		 503 aa  87.4  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  23.78 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  23.02 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  25.74 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  27.16 
 
 		 494 aa  72  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  22.99 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  24.03 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  24.03 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  24.03 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  24.03 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  24.03 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  24.06 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  23.81 
 
 		 516 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>