194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1984 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  80.13 
 
 		 461 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  83.04 
 
 		 460 aa  765    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  76.09 
 
 		 464 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  100 
 
 		 460 aa  909    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  73.42 
 
 		 464 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  75.12 
 
 		 461 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  68.85 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  46.07 
 
 		 460 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  28.99 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  29.91 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  28.63 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  30.57 
 
 		 490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  29.21 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  30.21 
 
 		 486 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  29.64 
 
 		 490 aa  163  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  29.7 
 
 		 490 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  29.7 
 
 		 490 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  29.7 
 
 		 490 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  29.7 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  28.48 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  32 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  30.8 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  30.79 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  30.73 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  28.42 
 
 		 490 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  28.72 
 
 		 490 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  28.07 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  30.48 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  28.72 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  27.29 
 
 		 492 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  29.41 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  26.58 
 
 		 492 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  27.56 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  28.69 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  29.18 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  28.15 
 
 		 507 aa  130  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 502 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 502 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  29.02 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  27.22 
 
 		 517 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  26.05 
 
 		 503 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  28.5 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  29.02 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  28.02 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  28.02 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  28.76 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.99 
 
 		 516 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  27.62 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.91 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  25.82 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.76 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  28.95 
 
 		 516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  28.95 
 
 		 516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.95 
 
 		 516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  28.95 
 
 		 516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.95 
 
 		 516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.95 
 
 		 516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  26.77 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  26.79 
 
 		 516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  26.12 
 
 		 516 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  26.56 
 
 		 516 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  26.12 
 
 		 516 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  25.89 
 
 		 516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  28.38 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  27.03 
 
 		 498 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  26.34 
 
 		 516 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  27.81 
 
 		 572 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  25.74 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  27.7 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  26.34 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  23.81 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 507 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  25.32 
 
 		 546 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  22.98 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  25.2 
 
 		 529 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  26.76 
 
 		 516 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  25.48 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  30.07 
 
 		 515 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  26.02 
 
 		 494 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  29.54 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  31.3 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  23.12 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.16 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  23.16 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  29.48 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  23.23 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  21.91 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.18 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  25.36 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  23.93 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  19.7 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2738  sodium/solute symporter  27.7 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640061  normal  0.0448149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1899  Na+/solute symporter  25.3 
 
 		 763 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  19.8 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  22.2 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>