More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2298 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  100 
 
 		 503 aa  981    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  36.04 
 
 		 507 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  32.45 
 
 		 495 aa  206  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  35.23 
 
 		 489 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  32.43 
 
 		 490 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  30.95 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  30.82 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  29.05 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  27.8 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  27.87 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  30.71 
 
 		 486 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  30.22 
 
 		 486 aa  170  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  30.09 
 
 		 486 aa  170  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  30.95 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  27.33 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  29.61 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  27.48 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  27.48 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  27.27 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  26.91 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  27.27 
 
 		 490 aa  163  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  26.69 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  27.67 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  29.14 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  30.79 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  27.33 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  26.38 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  26.21 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  27.18 
 
 		 490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.94 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.94 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  24.6 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  28.81 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  28.48 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  28.11 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  27.75 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  25.74 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  24.79 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.54 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  27.8 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  27.5 
 
 		 540 aa  103  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  27.92 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  25.71 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  29.2 
 
 		 524 aa  99.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  27.35 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.86 
 
 		 516 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  24.84 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  28.39 
 
 		 494 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  27.65 
 
 		 516 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  28.34 
 
 		 494 aa  97.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  26.14 
 
 		 483 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.18 
 
 		 487 aa  97.1  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  26.81 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 516 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  26.81 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  26.81 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 500 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  24.62 
 
 		 554 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 516 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  23.32 
 
 		 479 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  26.81 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  26.81 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  26.81 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  26.81 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  26.81 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  29.45 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  27.21 
 
 		 494 aa  95.1  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  28.14 
 
 		 516 aa  95.1  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  25.59 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  29.45 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  29.45 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  29.45 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  29.45 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  27.84 
 
 		 484 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  27.84 
 
 		 484 aa  94  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  22.7 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  27.84 
 
 		 484 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 503 aa  94  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  27.6 
 
 		 516 aa  94  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  28.82 
 
 		 516 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  28.82 
 
 		 516 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.82 
 
 		 516 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.82 
 
 		 516 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.82 
 
 		 516 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  28.82 
 
 		 516 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 527 aa  93.6  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  28.92 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  27.15 
 
 		 516 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  25.39 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 549 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  27.6 
 
 		 516 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  27.6 
 
 		 516 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  27.6 
 
 		 516 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  25.39 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  25.56 
 
 		 496 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  27.67 
 
 		 481 aa  91.3  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.66 
 
 		 500 aa  90.9  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  26.21 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  26.35 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>