More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2337 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  97.09 
 
 		 516 aa  962    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  93.41 
 
 		 516 aa  915    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  93.41 
 
 		 516 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  97.86 
 
 		 516 aa  964    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  93.02 
 
 		 516 aa  934    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  90.1 
 
 		 516 aa  863    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  100 
 
 		 516 aa  1011    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  96.71 
 
 		 516 aa  958    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  100 
 
 		 516 aa  1011    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  99.81 
 
 		 516 aa  1011    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  90.5 
 
 		 516 aa  885    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  93.41 
 
 		 516 aa  915    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  93.41 
 
 		 516 aa  915    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  89.92 
 
 		 516 aa  864    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  93.41 
 
 		 516 aa  941    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  93.41 
 
 		 516 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  93.41 
 
 		 516 aa  915    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  96.9 
 
 		 516 aa  934    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  57.91 
 
 		 509 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  56.46 
 
 		 503 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  54.71 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  55.9 
 
 		 554 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  54.73 
 
 		 547 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  55.15 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  54.84 
 
 		 546 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  55.24 
 
 		 491 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  56.52 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  52.16 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  52.16 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  55.38 
 
 		 493 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  55.95 
 
 		 527 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  53.74 
 
 		 507 aa  458  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  53.01 
 
 		 572 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  56.07 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  55.92 
 
 		 529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  53.21 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  55.73 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  55.48 
 
 		 491 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  51.11 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  43.13 
 
 		 530 aa  389  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  44.06 
 
 		 526 aa  352  8e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  45.29 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  50.43 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  43.75 
 
 		 520 aa  349  8e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  42.54 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  37.35 
 
 		 488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  28.75 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  29.63 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  28.63 
 
 		 490 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  31.59 
 
 		 486 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  31.12 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.75 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  28.51 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  28.75 
 
 		 490 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  28.36 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  28.36 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  28.75 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  28.81 
 
 		 490 aa  170  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  28.54 
 
 		 490 aa  170  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  29.07 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  30.88 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  27.97 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  28.34 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  29.34 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  29.3 
 
 		 486 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  27.8 
 
 		 492 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  28.67 
 
 		 490 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  26.37 
 
 		 490 aa  156  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  26.58 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  27.03 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.68 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  27.72 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  27 
 
 		 464 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  28.34 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  25.27 
 
 		 460 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.66 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.66 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  24.38 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  25.33 
 
 		 461 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  27.36 
 
 		 503 aa  103  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  26.03 
 
 		 461 aa  95.1  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.91 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  26.45 
 
 		 460 aa  92  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  23.99 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  25.14 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  24.75 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  27.42 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 524 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  21.93 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  24.28 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  22.72 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  24.15 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  25.76 
 
 		 1159 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  25.76 
 
 		 1159 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  23.31 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>