234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4492 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  80.94 
 
 		 491 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  100 
 
 		 500 aa  980    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  82.48 
 
 		 493 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  83.65 
 
 		 493 aa  759    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  64.48 
 
 		 502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  64.48 
 
 		 502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  65.08 
 
 		 498 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  64.4 
 
 		 491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  65.16 
 
 		 491 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  59.54 
 
 		 507 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  62.4 
 
 		 491 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  56.73 
 
 		 516 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.15 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  55.93 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  54.64 
 
 		 516 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  54.43 
 
 		 516 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  54.43 
 
 		 516 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  55.05 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  56.62 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  56.62 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  55.51 
 
 		 516 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.62 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  56.62 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.62 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.62 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  55.05 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  55.99 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  56.88 
 
 		 516 aa  485  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  56.4 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  55.37 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  54.09 
 
 		 509 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  53.86 
 
 		 500 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  51.43 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  49.81 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  49.9 
 
 		 554 aa  458  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  52.58 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  54.74 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  54.18 
 
 		 529 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  46.88 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  41.83 
 
 		 530 aa  360  3e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  40.6 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  45.35 
 
 		 515 aa  319  7e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  46.85 
 
 		 506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  38.65 
 
 		 520 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  36.99 
 
 		 492 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  33.74 
 
 		 488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  30.06 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  31.73 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  31.46 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  30.46 
 
 		 490 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  29.03 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  28.4 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  30.48 
 
 		 486 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  30.06 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  30.82 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  29.62 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  29.62 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  30.06 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  29.62 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  29.41 
 
 		 490 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  29.98 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  28.22 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  29.41 
 
 		 490 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  27.57 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  28.93 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  28.66 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  28.78 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  30.61 
 
 		 490 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  29.02 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  28.07 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  29.12 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  28.28 
 
 		 486 aa  150  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  28.31 
 
 		 490 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  25.85 
 
 		 492 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.71 
 
 		 495 aa  144  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  28.13 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  26.95 
 
 		 461 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  25.79 
 
 		 492 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  28.21 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  27.31 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.67 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.67 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  25.67 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  26.96 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  24.49 
 
 		 507 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.38 
 
 		 492 aa  80.1  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  24.59 
 
 		 489 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  25.11 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  24.3 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.14 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  21.59 
 
 		 494 aa  67  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.47 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  24.46 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  22.7 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1041  hypothetical protein  21.61 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.880803 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.3 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.38 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  21.76 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>