280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2256 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  89.92 
 
 		 516 aa  864    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  92.64 
 
 		 516 aa  907    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  90.12 
 
 		 516 aa  884    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  92.64 
 
 		 516 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  100 
 
 		 516 aa  1011    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  98.25 
 
 		 516 aa  996    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  92.64 
 
 		 516 aa  928    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  89.71 
 
 		 516 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  97.09 
 
 		 516 aa  962    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  97.29 
 
 		 516 aa  962    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  99.61 
 
 		 516 aa  1008    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  97.09 
 
 		 516 aa  962    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  97.48 
 
 		 516 aa  935    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  92.64 
 
 		 516 aa  907    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  92.64 
 
 		 516 aa  907    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  92.64 
 
 		 516 aa  931    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  92.64 
 
 		 516 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  92.64 
 
 		 516 aa  907    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  58.3 
 
 		 509 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  56.06 
 
 		 503 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  55.51 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  54.46 
 
 		 547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  55.9 
 
 		 554 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  55.53 
 
 		 549 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  54.97 
 
 		 546 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  55.76 
 
 		 491 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  52.99 
 
 		 502 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  55.98 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  52.99 
 
 		 502 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  56.94 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  55.56 
 
 		 527 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  52.62 
 
 		 572 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  53.94 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  55.92 
 
 		 529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  56.51 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  56.63 
 
 		 491 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  53.16 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  54.81 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  50.66 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  43.52 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  43.72 
 
 		 526 aa  352  8.999999999999999e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  50.21 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  45.08 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  44.38 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  41.83 
 
 		 492 aa  313  6.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  36.73 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  29.42 
 
 		 486 aa  181  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  31.83 
 
 		 486 aa  176  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  28.14 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  31.35 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  27.97 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  29.53 
 
 		 490 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  31.12 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  29.34 
 
 		 492 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  27.94 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  29.3 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  29.07 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  29.07 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  29.3 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  27.52 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  27.97 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  29.83 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  28.84 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  29.07 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  27.7 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  28.64 
 
 		 490 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  29.07 
 
 		 486 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  29.64 
 
 		 492 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  26.97 
 
 		 492 aa  153  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  27.03 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.68 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  27.92 
 
 		 517 aa  136  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.91 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  26.81 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  28.8 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  25.82 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.97 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  23.54 
 
 		 507 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.97 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  23.97 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  24.67 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  26.69 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  25 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.75 
 
 		 492 aa  90.1  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  23.99 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  25.41 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  27.06 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  27.42 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  21.46 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.8 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  23.24 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  23.55 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  24.59 
 
 		 494 aa  67  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26754  SSS family transporter: sodium ion/pantothenate  23.52 
 
 		 623 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.293152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  22.2 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 		 1158 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>