More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2870 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  100 
 
 
486 aa  951    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  69.9 
 
 
486 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  71.52 
 
 
486 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  71.4 
 
 
486 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  64.24 
 
 
490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  62.83 
 
 
492 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  63.79 
 
 
490 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  60.31 
 
 
490 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  62.63 
 
 
490 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  64.45 
 
 
490 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  60.09 
 
 
490 aa  551  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  60.09 
 
 
490 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  60.09 
 
 
490 aa  551  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  60.09 
 
 
490 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  60.09 
 
 
490 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  60.31 
 
 
490 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  59.87 
 
 
490 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  56.72 
 
 
490 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  58.91 
 
 
490 aa  545  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  59.87 
 
 
490 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  59.63 
 
 
486 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  50.31 
 
 
492 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  45.51 
 
 
486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  45.51 
 
 
486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  45.09 
 
 
486 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  47.24 
 
 
492 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  46.93 
 
 
492 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  45.04 
 
 
490 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  47.84 
 
 
517 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  35.7 
 
 
495 aa  249  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  33.96 
 
 
498 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  33.4 
 
 
507 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  32.69 
 
 
489 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  31.73 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  31.36 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  30.53 
 
 
503 aa  163  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.46 
 
 
516 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  29 
 
 
500 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  29.55 
 
 
491 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  29.63 
 
 
516 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  29.63 
 
 
516 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  29.3 
 
 
516 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  29.3 
 
 
516 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  29.3 
 
 
516 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  28.9 
 
 
516 aa  160  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  28.06 
 
 
572 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  30.16 
 
 
516 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  30.16 
 
 
516 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  30.16 
 
 
516 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  30.16 
 
 
516 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  30.16 
 
 
516 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  30.16 
 
 
516 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  30.68 
 
 
464 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  29.07 
 
 
516 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  29.33 
 
 
500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  28.84 
 
 
516 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  29.07 
 
 
516 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  29.77 
 
 
464 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  29 
 
 
503 aa  153  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  28.54 
 
 
509 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  27.58 
 
 
547 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  29.37 
 
 
461 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  29.7 
 
 
516 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  28.08 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  27.65 
 
 
493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  28.37 
 
 
516 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  29.26 
 
 
502 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  29.26 
 
 
502 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  29.21 
 
 
527 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  27.24 
 
 
530 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  27.31 
 
 
554 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  28.2 
 
 
460 aa  133  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  27.67 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  27.72 
 
 
549 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  28.72 
 
 
507 aa  131  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  28.22 
 
 
546 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  26.58 
 
 
488 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  26.39 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  25.3 
 
 
492 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  27.64 
 
 
491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  27.88 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  23.77 
 
 
526 aa  120  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  29 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  29.31 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  27.62 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  25.05 
 
 
520 aa  116  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  28.57 
 
 
506 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3350  Na+/solute symporter  26.02 
 
 
497 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  27.97 
 
 
515 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.87 
 
 
491 aa  90.9  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  23.61 
 
 
509 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  23.46 
 
 
509 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.29 
 
 
484 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  25.61 
 
 
524 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0047  Na+/solute symporter  24.42 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  23.6 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  24.09 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  28.38 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  23.06 
 
 
524 aa  76.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  27.67 
 
 
910 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>