275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2376 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  89.92 
 
 		 516 aa  863    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  92.25 
 
 		 516 aa  904    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  92.25 
 
 		 516 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  97.86 
 
 		 516 aa  961    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  99.61 
 
 		 516 aa  1008    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  92.25 
 
 		 516 aa  924    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  89.71 
 
 		 516 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  96.71 
 
 		 516 aa  959    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  97.09 
 
 		 516 aa  932    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  100 
 
 		 516 aa  1011    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  96.71 
 
 		 516 aa  959    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  96.9 
 
 		 516 aa  959    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  90.12 
 
 		 516 aa  883    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  92.25 
 
 		 516 aa  904    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  92.25 
 
 		 516 aa  904    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  92.25 
 
 		 516 aa  928    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  92.25 
 
 		 516 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  92.25 
 
 		 516 aa  904    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  58.5 
 
 		 509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  56.06 
 
 		 503 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  55.51 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  55.71 
 
 		 554 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  54.08 
 
 		 547 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  55.15 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  54.6 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  55.76 
 
 		 491 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  55.98 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  52.99 
 
 		 502 aa  475  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  52.99 
 
 		 502 aa  475  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  56.94 
 
 		 493 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  55.16 
 
 		 527 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  56.51 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  53.74 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  52.43 
 
 		 572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  55.73 
 
 		 529 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  53.16 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  56.4 
 
 		 491 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  54.81 
 
 		 491 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  50.66 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  43.52 
 
 		 530 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  43.72 
 
 		 526 aa  351  2e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  50 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  44.67 
 
 		 515 aa  346  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  43.7 
 
 		 520 aa  344  2.9999999999999997e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  41.83 
 
 		 492 aa  312  9e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  36.73 
 
 		 488 aa  296  6e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  29.01 
 
 		 486 aa  176  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  31.83 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  27.94 
 
 		 490 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  31.35 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  27.75 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  31.12 
 
 		 486 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  29.34 
 
 		 492 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  28.05 
 
 		 490 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  29.3 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  27.73 
 
 		 490 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  29.07 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.84 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  29.07 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  28.84 
 
 		 490 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  28.6 
 
 		 490 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  27.75 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  28.84 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  29.58 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  27.48 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  26.72 
 
 		 490 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  29.07 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  28.41 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  29.4 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  27.09 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  26.92 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.68 
 
 		 495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  27.72 
 
 		 517 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.65 
 
 		 464 aa  126  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  26.57 
 
 		 464 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  28.8 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  25.82 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  26.4 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  23.54 
 
 		 507 aa  114  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.97 
 
 		 486 aa  113  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  24.89 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  23.97 
 
 		 486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.97 
 
 		 486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  26.69 
 
 		 461 aa  97.4  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  25 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  27.32 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  27.42 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  25.14 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  21.46 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  23.24 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.52 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  23.55 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26754  SSS family transporter: sodium ion/pantothenate  23.52 
 
 		 623 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.293152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  22 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  25.51 
 
 		 1159 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>