More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3971 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  68.17 
 
 		 546 aa  680    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  76.12 
 
 		 554 aa  782    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  100 
 
 		 529 aa  1042    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  68.33 
 
 		 549 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  60.95 
 
 		 527 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  56.64 
 
 		 547 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  57 
 
 		 516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  55.31 
 
 		 503 aa  510  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  55.18 
 
 		 502 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  56.41 
 
 		 516 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  55.18 
 
 		 502 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  56.3 
 
 		 516 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  55.92 
 
 		 516 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  55.73 
 
 		 516 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  55.92 
 
 		 516 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  55.92 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  56.11 
 
 		 516 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  56.8 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  56.8 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  56.8 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.8 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.8 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.8 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  54.48 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  54.18 
 
 		 500 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  55.65 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  56.47 
 
 		 491 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  56.49 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  56.37 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  59.01 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  57 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  56.09 
 
 		 491 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  55.75 
 
 		 516 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  53.4 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  54.95 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  52.83 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  49.69 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  51.96 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  48.26 
 
 		 509 aa  422  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  43.43 
 
 		 515 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  41.51 
 
 		 530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  47.76 
 
 		 506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  40.34 
 
 		 526 aa  327  5e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  40.92 
 
 		 520 aa  302  8.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  35.57 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  35.98 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  28.23 
 
 		 490 aa  170  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  28.12 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  27.91 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  27.23 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  28.32 
 
 		 492 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  27.54 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  26.93 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  27.12 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  26.76 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  26.38 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.42 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  27.35 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  27.71 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  27.29 
 
 		 490 aa  150  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 490 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  27.65 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  27.65 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  28 
 
 		 490 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  28.16 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  27.66 
 
 		 486 aa  147  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  29.74 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  27.21 
 
 		 490 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  29.54 
 
 		 498 aa  144  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  28.38 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  26.23 
 
 		 492 aa  136  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 464 aa  127  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  26.07 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 517 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.39 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.5 
 
 		 486 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.5 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  24.5 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  26.29 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  23.74 
 
 		 460 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 461 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  23.37 
 
 		 461 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  22.96 
 
 		 507 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 492 aa  87  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  24.22 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  24.59 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  22.78 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.61 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  23.18 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  23.97 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  23.18 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  23.36 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  23.52 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  23.18 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.18 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  23.18 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  23.18 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  23.9 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>