More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3321 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  90.49 
 
 
516 aa  878    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  90.29 
 
 
516 aa  902    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  94.95 
 
 
516 aa  908    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  99.22 
 
 
516 aa  1001    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  89.71 
 
 
516 aa  899    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  89.9 
 
 
516 aa  882    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  89.9 
 
 
516 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  90.89 
 
 
516 aa  903    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  89.13 
 
 
516 aa  894    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  100 
 
 
516 aa  1009    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  90.1 
 
 
516 aa  902    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  89.71 
 
 
516 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  90.1 
 
 
516 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  89.9 
 
 
516 aa  882    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  89.9 
 
 
516 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  89.51 
 
 
516 aa  901    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  89.9 
 
 
516 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  89.9 
 
 
516 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  59.88 
 
 
509 aa  569  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  56.07 
 
 
503 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  56.26 
 
 
500 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  55.56 
 
 
554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  54.12 
 
 
547 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  53.85 
 
 
549 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  52.92 
 
 
502 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  52.92 
 
 
502 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  54.65 
 
 
546 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  56.63 
 
 
491 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  55.58 
 
 
493 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  56.31 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  53.98 
 
 
572 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  54.67 
 
 
527 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  53.25 
 
 
507 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  52.85 
 
 
498 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  53.31 
 
 
491 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  56.32 
 
 
529 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  55.31 
 
 
491 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  54.72 
 
 
491 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  51.77 
 
 
500 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  43.82 
 
 
530 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  43.05 
 
 
526 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  45.14 
 
 
515 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  49.89 
 
 
506 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  43.16 
 
 
520 aa  343  5e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  42.32 
 
 
492 aa  306  4.0000000000000004e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  37.2 
 
 
488 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  30.3 
 
 
486 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  28.42 
 
 
490 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  31.95 
 
 
486 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  31.78 
 
 
486 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  28.42 
 
 
490 aa  174  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  28.22 
 
 
490 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  28.25 
 
 
490 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  28.87 
 
 
490 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  29.03 
 
 
490 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  30.02 
 
 
490 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  28.22 
 
 
490 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  28.22 
 
 
490 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  31.45 
 
 
486 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  29.03 
 
 
490 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  27.47 
 
 
490 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  28.54 
 
 
492 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  29.02 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  28.02 
 
 
490 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  28.42 
 
 
490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  29.3 
 
 
486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  30.56 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  27.57 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  30.2 
 
 
490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  27.66 
 
 
492 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  27.4 
 
 
495 aa  150  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  26.78 
 
 
492 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  28.12 
 
 
517 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.83 
 
 
486 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.83 
 
 
486 aa  123  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  24.83 
 
 
486 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.63 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  26.74 
 
 
464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  27.15 
 
 
498 aa  120  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  25.77 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  25.11 
 
 
507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  26.99 
 
 
461 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  26.99 
 
 
460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  27.33 
 
 
503 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  24.5 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  25.07 
 
 
460 aa  93.2  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.35 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  25.27 
 
 
463 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  22.25 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  24.86 
 
 
494 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  25 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  25.2 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.59 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.79 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  22.94 
 
 
500 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  23.16 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.56 
 
 
524 aa  63.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.76 
 
 
492 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.61 
 
 
487 aa  60.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  25.51 
 
 
527 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>