284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3191 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  100 
 
 
490 aa  969    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  46.46 
 
 
492 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  46.99 
 
 
492 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  46.04 
 
 
490 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  45.4 
 
 
490 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  42.24 
 
 
490 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  41.96 
 
 
490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  44.03 
 
 
490 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  42.24 
 
 
490 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  42.24 
 
 
490 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  42.03 
 
 
490 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  42.03 
 
 
490 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  42.03 
 
 
490 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  42.03 
 
 
490 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  42.03 
 
 
490 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  42.92 
 
 
486 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  43.56 
 
 
490 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  41.81 
 
 
490 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  43.6 
 
 
492 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  44.85 
 
 
486 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  42.46 
 
 
490 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  43.17 
 
 
486 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  43.17 
 
 
486 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  41.92 
 
 
492 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  40.62 
 
 
486 aa  349  7e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  36.68 
 
 
486 aa  343  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  36.48 
 
 
486 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  36.48 
 
 
486 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  39.72 
 
 
517 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  31.65 
 
 
495 aa  225  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  32.86 
 
 
498 aa  207  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  27.84 
 
 
516 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  27.62 
 
 
516 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  28.66 
 
 
500 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  27.75 
 
 
503 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  29.09 
 
 
554 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  27.84 
 
 
516 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  26.82 
 
 
516 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  26.59 
 
 
516 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  26.37 
 
 
516 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  26.37 
 
 
516 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  27.73 
 
 
527 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  27.49 
 
 
547 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  28.44 
 
 
546 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  28.54 
 
 
493 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  27.06 
 
 
507 aa  153  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  28.05 
 
 
516 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  28.33 
 
 
493 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  27.44 
 
 
516 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  26.98 
 
 
516 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  28.75 
 
 
491 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.73 
 
 
516 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  27.4 
 
 
572 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  26.23 
 
 
516 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  26.67 
 
 
516 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  26.67 
 
 
516 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  26.17 
 
 
509 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.67 
 
 
516 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  26.67 
 
 
516 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.67 
 
 
516 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.67 
 
 
516 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  28.03 
 
 
529 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  28.31 
 
 
500 aa  143  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  26.26 
 
 
502 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  26.26 
 
 
502 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  27.57 
 
 
498 aa  141  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  26.59 
 
 
489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  27.18 
 
 
503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  27.27 
 
 
491 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  27.03 
 
 
491 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  27.25 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  26.82 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  26.1 
 
 
549 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  25.51 
 
 
464 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  27.62 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  27.25 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  25.99 
 
 
507 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  24.36 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  24.95 
 
 
492 aa  118  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  25.99 
 
 
461 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  24 
 
 
488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  25.12 
 
 
530 aa  110  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  26.97 
 
 
461 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  27.67 
 
 
463 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  26.14 
 
 
506 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  24.46 
 
 
520 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  26.33 
 
 
515 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  25.4 
 
 
460 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  23.92 
 
 
491 aa  85.9  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  22.87 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.57 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  26.06 
 
 
492 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  25.84 
 
 
492 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  26.06 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  25.17 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.77 
 
 
493 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  25.63 
 
 
492 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.51 
 
 
524 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  25.46 
 
 
562 aa  71.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  25.19 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>