More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2476 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  82.89 
 
 
492 aa  827    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  100 
 
 
492 aa  967    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  51.08 
 
 
490 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  51.51 
 
 
490 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  49.46 
 
 
490 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  49.59 
 
 
490 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  50.52 
 
 
492 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  48.07 
 
 
490 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  48.07 
 
 
490 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  47.4 
 
 
490 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  48.07 
 
 
490 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  48.07 
 
 
490 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  48.5 
 
 
490 aa  475  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  50.41 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  47.85 
 
 
490 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  48.5 
 
 
490 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  47.64 
 
 
490 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  49.8 
 
 
490 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  50.41 
 
 
486 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  50.21 
 
 
486 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  47.42 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  46.46 
 
 
490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  47.71 
 
 
486 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  46.77 
 
 
486 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  44.38 
 
 
492 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  40.62 
 
 
486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  40.41 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  40.33 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  44.24 
 
 
517 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  32.52 
 
 
495 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  31.09 
 
 
507 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  31.75 
 
 
498 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  32.49 
 
 
489 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  29.15 
 
 
503 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  28.9 
 
 
516 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  29.34 
 
 
516 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.4 
 
 
516 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  28.97 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  28.97 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.97 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.97 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  29.34 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.97 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  28.97 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  28.57 
 
 
516 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  28.34 
 
 
516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  28.34 
 
 
516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  28.57 
 
 
516 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  27.71 
 
 
503 aa  163  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  28.31 
 
 
516 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  28.31 
 
 
516 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  28.74 
 
 
516 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  27.06 
 
 
554 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  27.61 
 
 
549 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  28.84 
 
 
516 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  26.25 
 
 
492 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  26.34 
 
 
572 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  24.85 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  26.53 
 
 
509 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  25.41 
 
 
547 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  28.23 
 
 
546 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  26.6 
 
 
488 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  25.9 
 
 
502 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  25.9 
 
 
502 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  29.08 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.65 
 
 
464 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  27.37 
 
 
527 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  26.51 
 
 
460 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  25.41 
 
 
491 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  27.16 
 
 
460 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  26.19 
 
 
529 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  27.35 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  25.78 
 
 
530 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  26.25 
 
 
461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  24.32 
 
 
493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  24.25 
 
 
493 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  26.8 
 
 
491 aa  130  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  27.1 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  24.58 
 
 
500 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  29.43 
 
 
506 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  29.34 
 
 
461 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  26.11 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  25.98 
 
 
498 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  24.84 
 
 
507 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  24.39 
 
 
526 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  29.13 
 
 
515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  28.52 
 
 
463 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  23 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  24.45 
 
 
492 aa  104  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.68 
 
 
491 aa  97.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  25.92 
 
 
474 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.66 
 
 
524 aa  87.4  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  24.87 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3350  Na+/solute symporter  21.95 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0047  Na+/solute symporter  22.11 
 
 
508 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  23.26 
 
 
513 aa  76.6  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  24.12 
 
 
561 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  22.8 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.78 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  23.93 
 
 
561 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>