More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0238 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  100 
 
 		 489 aa  953    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  46.14 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  34.28 
 
 		 490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  32.99 
 
 		 495 aa  236  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  31.25 
 
 		 490 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  33.47 
 
 		 490 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  35.66 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  33.61 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  33.74 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  36.11 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  31.44 
 
 		 490 aa  223  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  31.03 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  30.8 
 
 		 490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  30.57 
 
 		 490 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  30.57 
 
 		 490 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  30.57 
 
 		 490 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  30.57 
 
 		 490 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  30.58 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  33.95 
 
 		 490 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  30.92 
 
 		 490 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  27.51 
 
 		 490 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  34.49 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  33.5 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  34.01 
 
 		 486 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  33.33 
 
 		 486 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  32.55 
 
 		 492 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  29.98 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  30.62 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  32.32 
 
 		 517 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  28.05 
 
 		 486 aa  173  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.05 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.65 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  28.6 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  31.01 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  30.93 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  26.48 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  30.38 
 
 		 491 aa  148  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  29.8 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  29.94 
 
 		 524 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  30.47 
 
 		 494 aa  136  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  31.4 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  27.18 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  27.2 
 
 		 479 aa  106  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  24.9 
 
 		 508 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.87 
 
 		 489 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  23.76 
 
 		 489 aa  99.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.44 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  24.77 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.68 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.47 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.68 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.47 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  23.87 
 
 		 489 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.68 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.68 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  26.23 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  27.27 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.83 
 
 		 518 aa  96.7  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  26.21 
 
 		 544 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.5 
 
 		 497 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.47 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.26 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  28.43 
 
 		 531 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  23.91 
 
 		 529 aa  92.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.26 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.84 
 
 		 495 aa  90.9  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.21 
 
 		 492 aa  90.9  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.4 
 
 		 493 aa  90.5  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  24.3 
 
 		 509 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.56 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  30.59 
 
 		 515 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  26.52 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.27 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  23.26 
 
 		 516 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  25.47 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.59 
 
 		 513 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 515 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.59 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  26.05 
 
 		 729 aa  87.4  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  22.49 
 
 		 516 aa  86.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  22.25 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  24.64 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.98 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0478  Na+/solute symporter  28.03 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.97 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.97 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  22.97 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.97 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.47 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  22.97 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  22.97 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  26.47 
 
 		 540 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  22.49 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  22.49 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  22.49 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  24.16 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  24.88 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  24.88 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>