270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2471 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  100 
 
 		 515 aa  981    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  64.52 
 
 		 506 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  46.11 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  46.11 
 
 		 516 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  44.21 
 
 		 554 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  45.29 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  46.11 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  46.11 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  45.29 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  45.29 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  45.29 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  46.11 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  46.11 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  46.11 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  46.11 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  46.05 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  45.83 
 
 		 516 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  45.36 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  45.08 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  46.23 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  45.86 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  43.82 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  45.86 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  44.76 
 
 		 500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  43.63 
 
 		 547 aa  352  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  42.97 
 
 		 549 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  43.35 
 
 		 516 aa  349  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  44.38 
 
 		 527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  43.22 
 
 		 546 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  44.09 
 
 		 529 aa  336  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  46.06 
 
 		 498 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  43.01 
 
 		 507 aa  333  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  44.35 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  44.79 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  44.12 
 
 		 572 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  45.19 
 
 		 493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  44.81 
 
 		 491 aa  325  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  41.35 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  44.66 
 
 		 491 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  44.3 
 
 		 491 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  43.92 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  37.62 
 
 		 530 aa  266  8e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  36.67 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  33.74 
 
 		 488 aa  228  3e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  35.1 
 
 		 526 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  31.51 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  30.08 
 
 		 492 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  29.22 
 
 		 490 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  30.56 
 
 		 490 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  29.13 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  29.98 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  27.8 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  29.98 
 
 		 486 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  32.2 
 
 		 486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  27.72 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  27.72 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  29.75 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  28.73 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.8 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  28.8 
 
 		 490 aa  134  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  27.54 
 
 		 490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  30.9 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  28.57 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  28.18 
 
 		 490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  29.9 
 
 		 490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  28.34 
 
 		 490 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  28.99 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  31.26 
 
 		 517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  29.21 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  27.52 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 507 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  28.9 
 
 		 486 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  27.01 
 
 		 498 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  25.4 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.86 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  27.32 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.88 
 
 		 486 aa  97.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  24.88 
 
 		 486 aa  97.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.88 
 
 		 486 aa  97.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  29.04 
 
 		 460 aa  93.6  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  31.43 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  30.08 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  30.07 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  27.75 
 
 		 503 aa  91.3  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  29.02 
 
 		 461 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  27.04 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  28.7 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26754  SSS family transporter: sodium ion/pantothenate  25.34 
 
 		 623 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.293152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.55 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.3 
 
 		 541 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  26.29 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  27.97 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  23.12 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  25.27 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  25.2 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  24.68 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  28.45 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.71 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  24.8 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>