More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4155 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  100 
 
 		 515 aa  1034    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  71.74 
 
 		 492 aa  728    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  58.95 
 
 		 479 aa  581  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  58.87 
 
 		 478 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  59.51 
 
 		 479 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  58.67 
 
 		 478 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  58.8 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  58.28 
 
 		 479 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  52.66 
 
 		 486 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  48.9 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  49.17 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  48.86 
 
 		 482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  49.16 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  46.63 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  49.79 
 
 		 475 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  40.08 
 
 		 460 aa  340  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  38.14 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  36.83 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  34.04 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.38 
 
 		 472 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 483 aa  126  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.25 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.44 
 
 		 474 aa  113  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.9 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.5 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 462 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.46 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.29 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.5 
 
 		 461 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  27.47 
 
 		 452 aa  107  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 527 aa  107  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.79 
 
 		 460 aa  104  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.66 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.71 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  27.7 
 
 		 459 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  24.89 
 
 		 489 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.39 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.39 
 
 		 459 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  25.11 
 
 		 489 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.56 
 
 		 490 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 505 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 505 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  22.99 
 
 		 524 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  25.78 
 
 		 505 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  24.52 
 
 		 479 aa  94  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.45 
 
 		 500 aa  90.9  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 459 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  25.56 
 
 		 505 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.76 
 
 		 463 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26 
 
 		 493 aa  88.2  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  25.12 
 
 		 459 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.59 
 
 		 522 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.08 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.89 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  34.54 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  24.07 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.56 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.1 
 
 		 557 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.38 
 
 		 523 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  22.22 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.32 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.39 
 
 		 551 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.57 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.71 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.23 
 
 		 557 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.91 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.51 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  22.31 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.6 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  27.99 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  22.3 
 
 		 529 aa  80.1  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.05 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  21.13 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.65 
 
 		 548 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  24.83 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  24.83 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  24.83 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.23 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  24.83 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  24.83 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  24.83 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  24.83 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  24.83 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  22.17 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  23.7 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  24.21 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1943  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  24.83 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.27 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.24 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0563  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1121 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>