288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3186 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0047  Na+/solute symporter  80.79 
 
 		 508 aa  785    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 		 509 aa  1019    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  96.27 
 
 		 509 aa  978    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3350  Na+/solute symporter  40.49 
 
 		 497 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.84 
 
 		 495 aa  107  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  25.86 
 
 		 490 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  23.5 
 
 		 486 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  23.52 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  23.97 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  22.41 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  26.29 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  26.29 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  26.29 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  26.29 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  26.29 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  26.29 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.35 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  26.13 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  25.98 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  23.7 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  25.43 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  23.53 
 
 		 486 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.83 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  23.09 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  23.16 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  22.63 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.45 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  23.6 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  25 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  23.03 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  24.92 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  23.13 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.03 
 
 		 516 aa  67  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  23.03 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.03 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  23.03 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  23.03 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  23.28 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  23.03 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.03 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.21 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  23.78 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  22.81 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  23.66 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  23.73 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  22.95 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  22.81 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  23.66 
 
 		 516 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  23.91 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  23.66 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  22.45 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  22.84 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  23.67 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  23.06 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  23.06 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  24.27 
 
 		 509 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  26.12 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  23.33 
 
 		 511 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  23.31 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.14 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  21.56 
 
 		 524 aa  62  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  23.77 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.04 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.14 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  28.24 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  23.14 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  22.82 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  23.14 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  21.09 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  23.98 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  23.14 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  21.4 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  24.46 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  23.11 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  24.22 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.04 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  23.43 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.39 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.06 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  22.33 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  23.46 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  22.5 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  22.5 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  22.65 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  22.65 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  22.5 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  22.65 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.65 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.65 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.65 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.92 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  22.06 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.65 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  22.78 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.36 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>