More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2133 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  100 
 
 
494 aa  949    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  60.92 
 
 
524 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  64.96 
 
 
492 aa  551  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  65.4 
 
 
494 aa  546  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  65.5 
 
 
494 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  33.49 
 
 
474 aa  237  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  33.41 
 
 
479 aa  204  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  30.86 
 
 
507 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  31.34 
 
 
489 aa  157  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  30.09 
 
 
491 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  29.53 
 
 
494 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  27.92 
 
 
483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  28.83 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  28.77 
 
 
503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  29.03 
 
 
484 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  29.03 
 
 
484 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  29.03 
 
 
484 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  29.76 
 
 
495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  28.08 
 
 
483 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  27.85 
 
 
483 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  27.7 
 
 
495 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  28.08 
 
 
483 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  28.08 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  27.85 
 
 
483 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  27.85 
 
 
483 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  27.85 
 
 
483 aa  127  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  27.85 
 
 
483 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  27.85 
 
 
483 aa  127  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  27.85 
 
 
483 aa  127  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  27.85 
 
 
483 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.42 
 
 
482 aa  127  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  27.85 
 
 
483 aa  127  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  27.85 
 
 
483 aa  126  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.63 
 
 
483 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  29.98 
 
 
513 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  28.08 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  27.8 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  30.57 
 
 
496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  27.78 
 
 
479 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  27.78 
 
 
479 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  28.27 
 
 
477 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  27.78 
 
 
479 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  27.78 
 
 
479 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  27.78 
 
 
479 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  27.78 
 
 
477 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  27.55 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  27.78 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  28.05 
 
 
490 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  28.4 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  27.95 
 
 
529 aa  117  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  28.2 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  28.51 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28.51 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  26.27 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  28.54 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  27.31 
 
 
477 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  29.05 
 
 
483 aa  114  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  29.05 
 
 
483 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  24.9 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
477 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  25.74 
 
 
491 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25.75 
 
 
493 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  27.88 
 
 
499 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.33 
 
 
510 aa  106  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  25.54 
 
 
490 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.27 
 
 
492 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  27.63 
 
 
512 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  24.71 
 
 
489 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.06 
 
 
492 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.76 
 
 
492 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.94 
 
 
489 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  27.42 
 
 
494 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  24.94 
 
 
489 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  28.5 
 
 
492 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  26.67 
 
 
464 aa  103  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 
496 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  27.19 
 
 
494 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  25.89 
 
 
516 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  25.73 
 
 
490 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.84 
 
 
544 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.64 
 
 
504 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  28.54 
 
 
498 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.89 
 
 
516 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  25.49 
 
 
543 aa  101  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  24.68 
 
 
490 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  25.89 
 
 
516 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  25.89 
 
 
516 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  26.36 
 
 
537 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.89 
 
 
516 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.89 
 
 
516 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.89 
 
 
516 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  25.89 
 
 
516 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  26.4 
 
 
486 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.29 
 
 
533 aa  100  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  24.78 
 
 
490 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  25.96 
 
 
516 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  24.78 
 
 
490 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  27.95 
 
 
562 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  27.27 
 
 
494 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  27.27 
 
 
494 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>