More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0309 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  100 
 
 
510 aa  1009    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  58.55 
 
 
527 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  52.89 
 
 
500 aa  530  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  54.06 
 
 
524 aa  531  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  30.65 
 
 
498 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  27.2 
 
 
513 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  28.23 
 
 
496 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.25 
 
 
492 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  27.06 
 
 
492 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.49 
 
 
493 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.38 
 
 
482 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.88 
 
 
492 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.48 
 
 
492 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.91 
 
 
487 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.64 
 
 
492 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
493 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
493 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.9 
 
 
492 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  29.76 
 
 
498 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.64 
 
 
488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  27.29 
 
 
536 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  27.85 
 
 
498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.48 
 
 
492 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.77 
 
 
485 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  28.43 
 
 
499 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  27.51 
 
 
528 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.45 
 
 
484 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  28.05 
 
 
497 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.39 
 
 
492 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.89 
 
 
492 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  29.23 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  26.72 
 
 
553 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.09 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.19 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.42 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.28 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.33 
 
 
492 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  27.57 
 
 
493 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.22 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  27.03 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  26.44 
 
 
483 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.39 
 
 
492 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.98 
 
 
492 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  27.53 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.69 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.89 
 
 
492 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.69 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  29.75 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.89 
 
 
492 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.89 
 
 
492 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  27.91 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  26.32 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  27.64 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  26.04 
 
 
483 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  26.04 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  28.89 
 
 
494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  28.03 
 
 
499 aa  130  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.17 
 
 
492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  27.53 
 
 
461 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  26.51 
 
 
484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  27.72 
 
 
494 aa  127  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  27.72 
 
 
494 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  27.72 
 
 
494 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.31 
 
 
472 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  27.25 
 
 
486 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09750  sodium/proline symporter  26.82 
 
 
520 aa  127  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000003829  hitchhiker  0.000045945 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.3 
 
 
483 aa  126  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.95 
 
 
492 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  27.12 
 
 
461 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  25.67 
 
 
477 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  25.41 
 
 
483 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  25.41 
 
 
483 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  25.41 
 
 
483 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  25.41 
 
 
483 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  28.02 
 
 
479 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  28.02 
 
 
479 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  28.02 
 
 
479 aa  123  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  28.02 
 
 
479 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  28.02 
 
 
479 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1943  Na+/solute symporter  26.5 
 
 
526 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.28 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  26.34 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  26.68 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  26.49 
 
 
489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  26.87 
 
 
502 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  26.87 
 
 
502 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.93 
 
 
482 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  27.56 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  25.91 
 
 
494 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  26.68 
 
 
502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  26.2 
 
 
502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  26.2 
 
 
502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  26.2 
 
 
502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  26.2 
 
 
502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  26.52 
 
 
566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.37 
 
 
483 aa  120  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  24.51 
 
 
511 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.15 
 
 
482 aa  120  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.35 
 
 
492 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>