290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0294 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  90.31 
 
 
516 aa  870    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 
516 aa  1009    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 
516 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  93.2 
 
 
516 aa  924    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  97.67 
 
 
516 aa  969    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  89.9 
 
 
516 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  93.41 
 
 
516 aa  932    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  93.8 
 
 
516 aa  904    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  93.6 
 
 
516 aa  932    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  92.64 
 
 
516 aa  924    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  92.25 
 
 
516 aa  919    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  93.41 
 
 
516 aa  932    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  89.53 
 
 
516 aa  885    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  100 
 
 
516 aa  1009    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 
516 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  99.61 
 
 
516 aa  1008    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  100 
 
 
516 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  100 
 
 
516 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  57.09 
 
 
509 aa  544  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  55.77 
 
 
503 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  56.15 
 
 
500 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  55.3 
 
 
547 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  55.24 
 
 
554 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  53.86 
 
 
549 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  55.83 
 
 
546 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  54.18 
 
 
502 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  57.26 
 
 
491 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  54.18 
 
 
502 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  57.67 
 
 
493 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  57 
 
 
493 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  54.83 
 
 
507 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  53.58 
 
 
572 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  55.36 
 
 
527 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  56.11 
 
 
529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  52.65 
 
 
498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  54.2 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  55.97 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  56.26 
 
 
491 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  50.44 
 
 
500 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  43.13 
 
 
530 aa  381  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  46.11 
 
 
515 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  49.79 
 
 
506 aa  346  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  43.6 
 
 
526 aa  345  1e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  43.91 
 
 
520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  40 
 
 
492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  36.85 
 
 
488 aa  294  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  30.15 
 
 
486 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  28.81 
 
 
490 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  28.48 
 
 
490 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  32.76 
 
 
486 aa  176  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  32.6 
 
 
486 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  28.75 
 
 
490 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  32.1 
 
 
486 aa  170  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  29.08 
 
 
490 aa  170  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  29.91 
 
 
490 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  28.81 
 
 
490 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.72 
 
 
490 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  28.81 
 
 
490 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  28.72 
 
 
490 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  28.6 
 
 
490 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  29.4 
 
 
492 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  28.4 
 
 
490 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  30 
 
 
490 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  28.37 
 
 
492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  28.34 
 
 
490 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  30.16 
 
 
486 aa  159  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  27.98 
 
 
490 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  28.64 
 
 
490 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  27.13 
 
 
490 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  27.57 
 
 
492 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  27.9 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  28.4 
 
 
464 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.87 
 
 
495 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  27.66 
 
 
517 aa  136  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  28.38 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  29.19 
 
 
460 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  26.37 
 
 
460 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  26.89 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  28.41 
 
 
498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  24.24 
 
 
486 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.24 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.24 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  24.79 
 
 
507 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  28.19 
 
 
503 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  26.87 
 
 
461 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  27.55 
 
 
463 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  25.66 
 
 
460 aa  95.1  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.35 
 
 
492 aa  88.2  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  25.34 
 
 
494 aa  84  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  22.97 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.72 
 
 
491 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  26.63 
 
 
524 aa  73.6  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  24.93 
 
 
494 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  24.43 
 
 
499 aa  68.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  24.26 
 
 
494 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  23.28 
 
 
509 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  23.48 
 
 
494 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  23.48 
 
 
494 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  23.48 
 
 
494 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 
492 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>