More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2434 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  100 
 
 		 517 aa  1009    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  47.74 
 
 		 490 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  50.31 
 
 		 490 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  49.36 
 
 		 490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  47.16 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  47.16 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  47.16 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  47.16 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  47.16 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  47.64 
 
 		 490 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  46.95 
 
 		 490 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  49.69 
 
 		 490 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  46.99 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  47.16 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  49.25 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  48.79 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  47.37 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  48.45 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  47.36 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  47.87 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  47.66 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  47.93 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  44.44 
 
 		 492 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  45.01 
 
 		 492 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  40.55 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  38.35 
 
 		 486 aa  360  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  38.35 
 
 		 486 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  37.94 
 
 		 486 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  39.92 
 
 		 490 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  31.05 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  30.5 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  32.11 
 
 		 498 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  32.8 
 
 		 489 aa  183  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  27.61 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.38 
 
 		 516 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  28.21 
 
 		 500 aa  143  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  28.32 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  26.73 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  28.66 
 
 		 503 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 554 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  28.96 
 
 		 500 aa  140  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  27.68 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  28.63 
 
 		 491 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  27.73 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  27.73 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  27.73 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.73 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  28.54 
 
 		 516 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.73 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.73 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  28.39 
 
 		 516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  27.22 
 
 		 460 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  27.87 
 
 		 530 aa  137  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  27.97 
 
 		 516 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 546 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  27.89 
 
 		 516 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  26.32 
 
 		 572 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  27.41 
 
 		 502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  27.41 
 
 		 502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  26.45 
 
 		 547 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  27.93 
 
 		 549 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 464 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  26.74 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  27.93 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  27.18 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  27.83 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  26.82 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  27.53 
 
 		 493 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  28.93 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  24.39 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  25.68 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  26.95 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  28 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  27.01 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  31.26 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  22.94 
 
 		 492 aa  113  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  27.05 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  27.12 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  25.93 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  26.64 
 
 		 460 aa  104  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.45 
 
 		 491 aa  94.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  23.63 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  25.19 
 
 		 524 aa  86.7  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  22.19 
 
 		 474 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.61 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  25.31 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  24.63 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0047  Na+/solute symporter  22.1 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  22.5 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  21.91 
 
 		 491 aa  67  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.11 
 
 		 1168 aa  67  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>