More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0047 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  80.79 
 
 
509 aa  805    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  80.17 
 
 
509 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0047  Na+/solute symporter  100 
 
 
508 aa  1019    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3350  Na+/solute symporter  41.6 
 
 
497 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  28.35 
 
 
495 aa  123  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  25.89 
 
 
507 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  23.21 
 
 
486 aa  97.4  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  25.42 
 
 
490 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  22.63 
 
 
490 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  24.84 
 
 
491 aa  87.4  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  23.69 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  24.16 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  25.68 
 
 
490 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  25.68 
 
 
490 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  24.17 
 
 
490 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  25.74 
 
 
490 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  25.47 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  25.47 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  24.62 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  25.47 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  25.89 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  25.16 
 
 
490 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  22.96 
 
 
490 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  24.02 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  24.89 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.29 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  21.52 
 
 
492 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  23.96 
 
 
486 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  22.27 
 
 
508 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  21.76 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  23.26 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  23.8 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  25.35 
 
 
494 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  24.02 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  23.27 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  22.79 
 
 
489 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.47 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  25.91 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  24.12 
 
 
512 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.42 
 
 
524 aa  69.3  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.01 
 
 
503 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  21.83 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  24.16 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  24.39 
 
 
525 aa  67  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  23.98 
 
 
482 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  24.31 
 
 
482 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  22.73 
 
 
492 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  24.31 
 
 
483 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.37 
 
 
486 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.11 
 
 
504 aa  64.3  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  25.84 
 
 
515 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.16 
 
 
533 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23 
 
 
533 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.18 
 
 
504 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  23.19 
 
 
516 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.28 
 
 
560 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  22.98 
 
 
516 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  23.19 
 
 
516 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  25.26 
 
 
537 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.39 
 
 
492 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  21.31 
 
 
575 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  22.67 
 
 
573 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  23.14 
 
 
516 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.59 
 
 
533 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  23 
 
 
492 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  23.2 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  23.2 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  23.2 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  23 
 
 
492 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  22.62 
 
 
482 aa  61.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.54 
 
 
516 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  23 
 
 
492 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23 
 
 
492 aa  61.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  22.76 
 
 
516 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  24.74 
 
 
614 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  24.75 
 
 
486 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  22.2 
 
 
461 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  22.93 
 
 
516 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  21.71 
 
 
486 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  24.66 
 
 
460 aa  60.5  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  23.08 
 
 
520 aa  60.1  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  22.1 
 
 
516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  23.74 
 
 
586 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  22.1 
 
 
516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  21.71 
 
 
486 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.26 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  21.71 
 
 
486 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  22.96 
 
 
506 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  20.71 
 
 
575 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  23.33 
 
 
506 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.93 
 
 
516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  24.66 
 
 
509 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  21.94 
 
 
513 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  21.35 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  21.57 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  21.57 
 
 
516 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  22.91 
 
 
530 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  23.32 
 
 
516 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  23.32 
 
 
516 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  21.06 
 
 
487 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>