More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0076 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  100 
 
 		 498 aa  969    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  77.56 
 
 		 491 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  76.84 
 
 		 491 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  67.33 
 
 		 502 aa  647    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  76.02 
 
 		 491 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  67.33 
 
 		 502 aa  647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  65.08 
 
 		 500 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  65.01 
 
 		 491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  65.04 
 
 		 493 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  65.03 
 
 		 493 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  60 
 
 		 500 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  59.17 
 
 		 507 aa  520  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  53.09 
 
 		 554 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  51.81 
 
 		 503 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  53.59 
 
 		 549 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  55.67 
 
 		 527 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  56.51 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  53.88 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  56.07 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  56.07 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  56.29 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  56.07 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  56.51 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  51.51 
 
 		 547 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  52.21 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  56.56 
 
 		 516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.33 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  56.33 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  56.33 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.33 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.33 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  56.33 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  55.65 
 
 		 529 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  56.51 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  56.39 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  56.83 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  56.18 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  50.59 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  49.6 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  42.15 
 
 		 530 aa  331  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  47.52 
 
 		 506 aa  316  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  47.11 
 
 		 515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  39.6 
 
 		 520 aa  293  4e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  36.98 
 
 		 526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  36.51 
 
 		 492 aa  279  7e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  36.19 
 
 		 488 aa  269  8.999999999999999e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  29.72 
 
 		 490 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  29.13 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  29.36 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  29.36 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  29.36 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  29.15 
 
 		 490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  29.93 
 
 		 490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  29.93 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  29.09 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  30.77 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  28.57 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  29.72 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  30.33 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 490 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  29.67 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  29.87 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  30.47 
 
 		 464 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  29.95 
 
 		 486 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  30.1 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  28.87 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  29.21 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  29.18 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  28.86 
 
 		 486 aa  146  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  29.34 
 
 		 490 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  27.12 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  29.42 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  28.54 
 
 		 498 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  25.73 
 
 		 492 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  29.36 
 
 		 492 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.87 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.87 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  27.87 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  26.85 
 
 		 460 aa  123  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  26.17 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  24.64 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  27.01 
 
 		 517 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  26.17 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  27.6 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  26.06 
 
 		 507 aa  97.8  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  25.3 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  26.56 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.4 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  22.86 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.44 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  25.91 
 
 		 524 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  26.32 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  23.94 
 
 		 564 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2738  sodium/solute symporter  25 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640061  normal  0.0448149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  22.06 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  23.78 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  25.7 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>