176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2363 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  100 
 
 
507 aa  993    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  59.64 
 
 
500 aa  568  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  59.07 
 
 
491 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  58.1 
 
 
502 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  58.1 
 
 
502 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  59.3 
 
 
493 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  61.5 
 
 
493 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  58.4 
 
 
498 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  56.91 
 
 
491 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  58.41 
 
 
491 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  56.74 
 
 
516 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  56.37 
 
 
516 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  56.37 
 
 
516 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  56.16 
 
 
516 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  56.16 
 
 
516 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  56.16 
 
 
516 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  54.64 
 
 
516 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  54.56 
 
 
516 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  56.96 
 
 
491 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  56.93 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  56.93 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  55.19 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.93 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  56.93 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.93 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.93 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  50.96 
 
 
547 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  51.65 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  55.63 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  56.28 
 
 
516 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  55.94 
 
 
516 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  48.26 
 
 
549 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  48.24 
 
 
554 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  54.42 
 
 
509 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  48.98 
 
 
500 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  50.69 
 
 
546 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  51.28 
 
 
529 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  50.2 
 
 
527 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  49.55 
 
 
572 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  42.63 
 
 
530 aa  337  1.9999999999999998e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  44.34 
 
 
515 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  39.33 
 
 
526 aa  312  9e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  40 
 
 
520 aa  296  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  43.07 
 
 
506 aa  296  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  38.63 
 
 
492 aa  288  2e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  34.83 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  28.36 
 
 
490 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  26.28 
 
 
490 aa  167  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  28.36 
 
 
490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  28.36 
 
 
490 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  28.36 
 
 
490 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  28.36 
 
 
490 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  28.14 
 
 
490 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.14 
 
 
490 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  28.14 
 
 
490 aa  160  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  27.93 
 
 
490 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  28.81 
 
 
486 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  27.41 
 
 
490 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  28.81 
 
 
486 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  27.71 
 
 
486 aa  149  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  28.36 
 
 
486 aa  148  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  27.11 
 
 
490 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  27.34 
 
 
490 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  27.56 
 
 
490 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  27.85 
 
 
492 aa  144  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  28.51 
 
 
460 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  28.61 
 
 
486 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  26.58 
 
 
464 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.56 
 
 
464 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  26.59 
 
 
490 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  26.82 
 
 
498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  27.31 
 
 
460 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  26.22 
 
 
490 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  25.17 
 
 
492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  24.1 
 
 
492 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  24.37 
 
 
492 aa  124  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  24.69 
 
 
461 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  28.03 
 
 
517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  25.73 
 
 
507 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  23.19 
 
 
495 aa  117  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  25.15 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  25.23 
 
 
461 aa  110  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  23.16 
 
 
486 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.51 
 
 
486 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.51 
 
 
486 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  27.35 
 
 
503 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  24.68 
 
 
460 aa  97.8  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  25.52 
 
 
494 aa  87.4  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  25.12 
 
 
494 aa  84  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  23.53 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  24.21 
 
 
494 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  24.26 
 
 
524 aa  74.3  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.25 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  25.16 
 
 
483 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  22.92 
 
 
489 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3186  sodium:solute symporter family protein  23.29 
 
 
509 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3052  Na+/solute symporter  24.03 
 
 
509 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0985518  normal  0.155892 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23.04 
 
 
482 aa  57.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  26.53 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  24.46 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>