135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0889 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  100 
 
 
492 aa  964    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  52.49 
 
 
530 aa  473  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  46.65 
 
 
520 aa  421  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  47.63 
 
 
526 aa  413  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  42.54 
 
 
516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  42.54 
 
 
516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  42.54 
 
 
516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  42.32 
 
 
516 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  40.71 
 
 
516 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  41.83 
 
 
516 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  41.83 
 
 
516 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  40.23 
 
 
503 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  40.93 
 
 
516 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  42.47 
 
 
516 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  42.47 
 
 
516 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  42.47 
 
 
516 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  42.47 
 
 
516 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  42.47 
 
 
516 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  42.47 
 
 
516 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  42.09 
 
 
516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  41.94 
 
 
516 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  38.73 
 
 
549 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  39.35 
 
 
509 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  42.47 
 
 
516 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  37.34 
 
 
554 aa  293  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  42.09 
 
 
516 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  38.82 
 
 
491 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  40.14 
 
 
546 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  37.01 
 
 
547 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  36.99 
 
 
500 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  36.98 
 
 
572 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  39.43 
 
 
493 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  38.18 
 
 
493 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  38.51 
 
 
507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  34.45 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  34.45 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  35.7 
 
 
498 aa  263  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  35.71 
 
 
527 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  37.61 
 
 
529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  34.06 
 
 
500 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  33.67 
 
 
491 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  35.06 
 
 
491 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  35.53 
 
 
491 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  32.91 
 
 
488 aa  224  3e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  33.86 
 
 
506 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  31.74 
 
 
515 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  28.43 
 
 
486 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  28.23 
 
 
486 aa  156  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  25.77 
 
 
490 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  26.11 
 
 
492 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  28.54 
 
 
486 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  25.15 
 
 
490 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  26.34 
 
 
492 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  26.27 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  24.49 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  26.42 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  26.32 
 
 
490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  26.23 
 
 
490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  26.64 
 
 
490 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  26.4 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  26.4 
 
 
490 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  25.79 
 
 
490 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  26.17 
 
 
490 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  26.17 
 
 
490 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  26.34 
 
 
490 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  24.54 
 
 
492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  24.94 
 
 
486 aa  136  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  26.17 
 
 
490 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  24.85 
 
 
490 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  25.39 
 
 
486 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.9 
 
 
486 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.9 
 
 
486 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  25.74 
 
 
486 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  24.95 
 
 
490 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  22.47 
 
 
495 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  23.9 
 
 
507 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  24.19 
 
 
464 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  22.94 
 
 
517 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  22.63 
 
 
460 aa  96.7  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  23.14 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  23.7 
 
 
461 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  24.22 
 
 
503 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  23.74 
 
 
461 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  23.3 
 
 
498 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  23.12 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  22.89 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  26.24 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  22.39 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  24.68 
 
 
492 aa  58.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  24.88 
 
 
491 aa  57.4  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.18 
 
 
487 aa  57  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  22.44 
 
 
496 aa  57  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  25.19 
 
 
494 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  26.57 
 
 
1157 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.68 
 
 
500 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  20.65 
 
 
460 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  22.82 
 
 
483 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  22.63 
 
 
483 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  23.95 
 
 
524 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.74 
 
 
1159 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>