More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0724 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  70.83 
 
 
546 aa  714    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  100 
 
 
554 aa  1107    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  68.96 
 
 
549 aa  723    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  76.12 
 
 
529 aa  728    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  58.26 
 
 
547 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  60.43 
 
 
527 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.08 
 
 
516 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  55.88 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  55.9 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  54.11 
 
 
572 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  55.71 
 
 
516 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  55.9 
 
 
516 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  55.71 
 
 
516 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  55.9 
 
 
516 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  55.71 
 
 
516 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  56.08 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  56.08 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.08 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  56.08 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.08 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  56.08 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  55.62 
 
 
516 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  55.81 
 
 
516 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  51.47 
 
 
503 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  56.41 
 
 
516 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  55.05 
 
 
516 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  53.25 
 
 
502 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  53.25 
 
 
502 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  54.08 
 
 
491 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  49.9 
 
 
500 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  53.09 
 
 
498 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  56.83 
 
 
491 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  55.03 
 
 
491 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  50.9 
 
 
491 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  48.79 
 
 
507 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  50.1 
 
 
493 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  47.68 
 
 
509 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  51.81 
 
 
493 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  49.34 
 
 
500 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  45.86 
 
 
515 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  43.7 
 
 
530 aa  347  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  48.16 
 
 
506 aa  326  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  39.31 
 
 
526 aa  325  1e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  42.83 
 
 
520 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  37.74 
 
 
492 aa  302  1e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  37.06 
 
 
488 aa  292  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  30.02 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  29.66 
 
 
486 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  30.43 
 
 
486 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  30.34 
 
 
486 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  28.57 
 
 
490 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  28.92 
 
 
490 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  28.92 
 
 
490 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  28.57 
 
 
490 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  29.09 
 
 
490 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  28.66 
 
 
490 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  28.71 
 
 
490 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  30.69 
 
 
486 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  28.17 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  27.54 
 
 
490 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  28.31 
 
 
490 aa  163  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  27.22 
 
 
492 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  28.73 
 
 
490 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  27.98 
 
 
490 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  27.97 
 
 
490 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  28.71 
 
 
492 aa  156  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  27.94 
 
 
492 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  27.97 
 
 
490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  27.51 
 
 
490 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  28.14 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  28.51 
 
 
492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  25.86 
 
 
517 aa  133  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.94 
 
 
495 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  27.67 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.81 
 
 
486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  25.81 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.81 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  23.81 
 
 
460 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  25.48 
 
 
464 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  23.92 
 
 
464 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  24.62 
 
 
503 aa  100  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  24.43 
 
 
461 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  23.24 
 
 
460 aa  97.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  24.75 
 
 
461 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  25.2 
 
 
492 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  23.68 
 
 
507 aa  85.9  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  24.1 
 
 
463 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  24.16 
 
 
460 aa  78.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  23.52 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  29 
 
 
491 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  26.26 
 
 
524 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  24.71 
 
 
494 aa  69.3  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  25.7 
 
 
494 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  21.79 
 
 
552 aa  67  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  23.49 
 
 
549 aa  64.7  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  23.89 
 
 
510 aa  64.7  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  21.48 
 
 
549 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  24.86 
 
 
527 aa  64.7  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.89 
 
 
482 aa  63.9  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.16 
 
 
500 aa  64.3  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>