144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1077 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1077  Na+ symporter  100 
 
 
520 aa  1000    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00128504  normal  0.725494 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1496  Na+/solute symporter  54.51 
 
 
530 aa  488  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  51.72 
 
 
526 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0889  Na+/solute symporter  46.65 
 
 
492 aa  427  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  45.3 
 
 
516 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  45.3 
 
 
516 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  45.3 
 
 
516 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5680  Na+/solute symporter  45.49 
 
 
516 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.496418  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2256  Na+/solute symporter  46.27 
 
 
516 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904619  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  44.2 
 
 
503 aa  349  8e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2376  Na+/solute symporter  46.27 
 
 
516 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  45.45 
 
 
516 aa  347  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  45.05 
 
 
516 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  45.97 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  45.97 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  45.97 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  45.97 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  45.97 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  45.97 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0940  Na+/solute symporter  46.48 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680103  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1225  Na+/solute symporter  46.12 
 
 
516 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3321  Na+/solute symporter  46.59 
 
 
516 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168139  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  44.05 
 
 
547 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2107  Na+/solute symporter  45.69 
 
 
516 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  42.18 
 
 
572 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0724  Na+/solute symporter  43.26 
 
 
554 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4492  Na+/solute symporter  39.04 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6999  Na+/solute symporter  43.29 
 
 
549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1445  Na+/solute symporter  40.79 
 
 
509 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  37.6 
 
 
502 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  37.6 
 
 
502 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  40.35 
 
 
507 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0791  Na+/monocarboxylate symporter  39.47 
 
 
493 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4479  Na+/solute symporter  40.35 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2056  Na+/solute symporter  43.27 
 
 
527 aa  286  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3900  Na+/solute symporter  40.12 
 
 
491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1921  Na+/solute symporter  43.62 
 
 
546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0076  Na+/solute symporter  38.57 
 
 
498 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470505  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4525  Na+/solute symporter  38.89 
 
 
491 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3971  monocarboxylic acid permease  42.6 
 
 
529 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691283  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6401  Na+/solute symporter  39.52 
 
 
491 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.134599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5820  monocarboxylic acid permease  37.74 
 
 
491 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  34.77 
 
 
488 aa  247  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2024  Na+/solute symporter  35.1 
 
 
500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976623  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2471  Na+/solute symporter  38.86 
 
 
515 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1570  Na+/solute symporter  38.79 
 
 
506 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  26.24 
 
 
490 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  26.02 
 
 
490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  26.4 
 
 
490 aa  143  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  25.82 
 
 
490 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  25.94 
 
 
490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  25.94 
 
 
490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  25.74 
 
 
490 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  25.92 
 
 
490 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  25.74 
 
 
490 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  25.05 
 
 
490 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  26.19 
 
 
490 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  26.34 
 
 
492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  25.56 
 
 
490 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  25.87 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  25.87 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  25.4 
 
 
486 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  25.5 
 
 
490 aa  127  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  25.26 
 
 
490 aa  123  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  24.43 
 
 
490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  23 
 
 
492 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  27.01 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  23.42 
 
 
492 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  25 
 
 
486 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.4 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  23.17 
 
 
486 aa  113  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  24.06 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  26.75 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  24.46 
 
 
490 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  27.15 
 
 
461 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  26.39 
 
 
464 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  26.08 
 
 
461 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  26.35 
 
 
460 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  27.24 
 
 
507 aa  98.6  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  25.9 
 
 
460 aa  97.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  24.87 
 
 
498 aa  96.7  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.79 
 
 
486 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.79 
 
 
486 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  23.79 
 
 
486 aa  95.9  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  24.54 
 
 
503 aa  87.8  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  27.8 
 
 
463 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  26.12 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  26.41 
 
 
492 aa  67  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  23.79 
 
 
489 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0758  Na+/solute symporter  22.2 
 
 
460 aa  64.7  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434271  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.27 
 
 
483 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  26.24 
 
 
524 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  30.91 
 
 
494 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  24.76 
 
 
494 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  26.79 
 
 
527 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  23.63 
 
 
481 aa  54.3  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  23.45 
 
 
484 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  23.45 
 
 
484 aa  53.5  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  23.45 
 
 
484 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  23.7 
 
 
483 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>