More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1899 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1899  Na+/solute symporter  100 
 
 		 763 aa  1535    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0671  Na+/solute symporter  57.54 
 
 		 701 aa  820    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2003  Na+/solute symporter  57.93 
 
 		 724 aa  880    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357117 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2001  hypothetical protein  39.89 
 
 		 294 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  30.3 
 
 		 474 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  29.63 
 
 		 491 aa  94.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  31.78 
 
 		 479 aa  94.7  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  30.37 
 
 		 494 aa  92  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  31.22 
 
 		 524 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  33.51 
 
 		 494 aa  86.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  31.03 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  29.76 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  30.05 
 
 		 479 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  30.54 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  30.54 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  30.54 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  27.98 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  30.69 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  29.06 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  28.09 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  30.05 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  29.47 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  23.84 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  27.75 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  28.99 
 
 		 495 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  28.47 
 
 		 526 aa  69.7  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  29.91 
 
 		 513 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  28.97 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  30.57 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  27.94 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  28.43 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  28.43 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.91 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.57 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  25.4 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  28.43 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  27.57 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  24.88 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7628  Na+/solute symporter  26.63 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.84 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  29.75 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.84 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.57 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  27.52 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  25.33 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  31.45 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  29.7 
 
 		 515 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  26.8 
 
 		 484 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 499 aa  63.5  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  28.43 
 
 		 544 aa  63.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 482 aa  63.9  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  25.59 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.19 
 
 		 485 aa  63.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  25.59 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  26.83 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  29.38 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  25.59 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5942  sodium/proline symporter  29.06 
 
 		 500 aa  63.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  23.63 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  24.66 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  25 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  28.57 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1359  Na+/solute symporter  24.57 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  26.03 
 
 		 499 aa  62  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  29.29 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  25.62 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  27.59 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4604  sodium/proline symporter  27.23 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  23.26 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  24.69 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  26.26 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  28.97 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0149  Sodium/proline symporter  26.6 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  24.14 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  26.57 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29910  sodium/proline symporter  24.11 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  26.83 
 
 		 494 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  26.75 
 
 		 488 aa  60.1  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.09 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  25.62 
 
 		 481 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.69 
 
 		 492 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  25 
 
 		 544 aa  60.1  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  27.72 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2384  Na+/solute symporter  28.22 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  26.83 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0389  sodium/proline symporter  24.7 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.279502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1984  Na+/solute symporter  25.3 
 
 		 460 aa  60.1  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.77 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  23.5 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  27.72 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  25.57 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>