More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4604 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4604  sodium/proline symporter  100 
 
 		 520 aa  1001    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  47.73 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0389  sodium/proline symporter  49.7 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.279502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  45.17 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  44.42 
 
 		 482 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  45.42 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  46.42 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  45.69 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  46.05 
 
 		 492 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  45.85 
 
 		 492 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  46.09 
 
 		 496 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  46.62 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  45.85 
 
 		 492 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  45.85 
 
 		 492 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  42.97 
 
 		 492 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  42.52 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  42.49 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  42.49 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  42.49 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  42.49 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  42.49 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  45.85 
 
 		 492 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  44.13 
 
 		 511 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  45.65 
 
 		 492 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  42.49 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  43.56 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  42.29 
 
 		 492 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  44.47 
 
 		 492 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  43.54 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  42.94 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  43.93 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  42.74 
 
 		 493 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  42.74 
 
 		 493 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  42.74 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  42.74 
 
 		 493 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  44.14 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  42.74 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  43.48 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  43.14 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  42.94 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  43.7 
 
 		 502 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  43.14 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  43.53 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  43.28 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  42.97 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  44.19 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  44.19 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  45.69 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  44.19 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  44.19 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  44.19 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  44.19 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  42.74 
 
 		 492 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  43.99 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  44.38 
 
 		 502 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  43.99 
 
 		 503 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  44.47 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  41.35 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  44.27 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  43.99 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  43.99 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  43.8 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  43.99 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  44.12 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  42.24 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  40.95 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  43.65 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  44.62 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  44.12 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  44.12 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  44.33 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  44.51 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  40.95 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  44.91 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  44.88 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  44.71 
 
 		 497 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5942  sodium/proline symporter  46.11 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  42.97 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  44.2 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  42.77 
 
 		 486 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  43.43 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  39.92 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  44.82 
 
 		 483 aa  369  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  39.84 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  45.56 
 
 		 498 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  42.66 
 
 		 483 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  43.36 
 
 		 498 aa  363  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  43.03 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  42.63 
 
 		 483 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  43.03 
 
 		 483 aa  359  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  43.03 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  37.35 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  44.51 
 
 		 488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  43.03 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  43.03 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  43.03 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  43.03 
 
 		 483 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  46.38 
 
 		 496 aa  353  5e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  45.51 
 
 		 498 aa  353  5.9999999999999994e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  42.38 
 
 		 498 aa  352  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>