More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0671 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0671  Na+/solute symporter  100 
 
 
701 aa  1387    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2003  Na+/solute symporter  57.6 
 
 
724 aa  820    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.357117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1899  Na+/solute symporter  58.06 
 
 
763 aa  800    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2001  hypothetical protein  40.56 
 
 
294 aa  124  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  35.02 
 
 
479 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  31.66 
 
 
491 aa  97.4  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  31.63 
 
 
474 aa  94.7  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  31.71 
 
 
494 aa  87.8  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  33.33 
 
 
524 aa  87.4  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  33.73 
 
 
494 aa  83.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  30.36 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  31.12 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  31.06 
 
 
494 aa  80.5  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  30.1 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  29.59 
 
 
479 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  29.15 
 
 
495 aa  76.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  29.59 
 
 
479 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  29.59 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  28.31 
 
 
492 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  28.32 
 
 
471 aa  73.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  28.09 
 
 
493 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  27.93 
 
 
507 aa  71.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  29.39 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  32.28 
 
 
495 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  28.96 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  30.11 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  26.62 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  28.38 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  26.62 
 
 
489 aa  67.8  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  26.62 
 
 
489 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.15 
 
 
492 aa  64.7  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1943  Na+/solute symporter  29.18 
 
 
526 aa  63.9  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.64 
 
 
483 aa  63.9  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.64 
 
 
482 aa  63.9  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2838  Na+/solute symporter  28.06 
 
 
526 aa  63.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.54 
 
 
482 aa  63.9  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  28.44 
 
 
513 aa  63.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6667  Na+/solute symporter  26.18 
 
 
463 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal  0.266697 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.78 
 
 
544 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  27.5 
 
 
482 aa  63.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  27.18 
 
 
515 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  28.74 
 
 
494 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  28.5 
 
 
496 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  28.86 
 
 
461 aa  62  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  28.63 
 
 
484 aa  62  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  25.76 
 
 
483 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  28.42 
 
 
479 aa  61.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  29.47 
 
 
519 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  29.95 
 
 
494 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  28.8 
 
 
495 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.27 
 
 
483 aa  60.8  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 
483 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  25.45 
 
 
498 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  25.88 
 
 
508 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5942  sodium/proline symporter  28.57 
 
 
500 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 
483 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 
483 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 
483 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 
483 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 
483 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.81 
 
 
512 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  25.41 
 
 
499 aa  59.3  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  22.59 
 
 
577 aa  59.7  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  26.04 
 
 
499 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25.81 
 
 
512 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  28.08 
 
 
506 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  28.08 
 
 
506 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  28.04 
 
 
495 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.72 
 
 
504 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 
483 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  27.81 
 
 
540 aa  58.9  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  26.2 
 
 
483 aa  58.9  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.66 
 
 
493 aa  58.9  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  23.66 
 
 
483 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  25.66 
 
 
499 aa  58.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  26.38 
 
 
492 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  26.38 
 
 
492 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  28 
 
 
460 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3558  Na+/solute symporter  25 
 
 
461 aa  58.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177602  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  28.95 
 
 
492 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  25.82 
 
 
483 aa  57.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.92 
 
 
478 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  27.39 
 
 
490 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.74 
 
 
492 aa  57  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09750  sodium/proline symporter  28.9 
 
 
520 aa  57  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000003829  hitchhiker  0.000045945 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  25.41 
 
 
483 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  31.61 
 
 
591 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  25.68 
 
 
496 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  28.65 
 
 
481 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6053  Na+/solute symporter  22.19 
 
 
464 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0408464  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  25.45 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.17 
 
 
492 aa  56.6  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  25.41 
 
 
483 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.7 
 
 
492 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  25.45 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  28.11 
 
 
488 aa  56.2  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  25.41 
 
 
483 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  31.85 
 
 
638 aa  56.2  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  25.45 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  25.41 
 
 
483 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>