More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1943 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1943  Na+/solute symporter  100 
 
 
526 aa  1018    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  26.38 
 
 
524 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  29.57 
 
 
529 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28.77 
 
 
497 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  28.6 
 
 
527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.99 
 
 
518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  29.98 
 
 
498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  28.01 
 
 
498 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  30.3 
 
 
482 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  28.31 
 
 
493 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  27.53 
 
 
483 aa  143  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.5 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.64 
 
 
488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.44 
 
 
492 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.09 
 
 
492 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.21 
 
 
492 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  30.52 
 
 
492 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.38 
 
 
500 aa  137  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  27.45 
 
 
513 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.38 
 
 
504 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.7 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.99 
 
 
488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  27.02 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.08 
 
 
484 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.74 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  28.25 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.07 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.14 
 
 
492 aa  131  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  27.96 
 
 
512 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  27.96 
 
 
512 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  26.82 
 
 
484 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.55 
 
 
492 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.55 
 
 
492 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  26.82 
 
 
484 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  26.82 
 
 
484 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.36 
 
 
492 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.36 
 
 
492 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.36 
 
 
492 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  27.38 
 
 
486 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.46 
 
 
485 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.95 
 
 
492 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.83 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.51 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.33 
 
 
483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.19 
 
 
496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  26.82 
 
 
496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  26.97 
 
 
483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  28.18 
 
 
499 aa  128  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  26.87 
 
 
481 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.45 
 
 
492 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  27.05 
 
 
498 aa  126  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  28.08 
 
 
499 aa  126  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  29.03 
 
 
483 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  29.03 
 
 
483 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  26.11 
 
 
483 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  29.03 
 
 
483 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.76 
 
 
482 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  29.03 
 
 
483 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.5 
 
 
492 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  29.03 
 
 
483 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  29.03 
 
 
483 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.83 
 
 
478 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  25.76 
 
 
483 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  25.76 
 
 
483 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  29.03 
 
 
483 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  27.35 
 
 
495 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  28.94 
 
 
494 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  27.11 
 
 
488 aa  125  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  24.73 
 
 
483 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  25.76 
 
 
483 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  29.03 
 
 
483 aa  125  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  26.8 
 
 
504 aa  124  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09750  sodium/proline symporter  26.64 
 
 
520 aa  124  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000003829  hitchhiker  0.000045945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.65 
 
 
506 aa  123  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  28.34 
 
 
483 aa  123  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  26.39 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  25.98 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.89 
 
 
489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  25.98 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  25.98 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  25.98 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  27.48 
 
 
511 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.77 
 
 
492 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.1 
 
 
544 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.48 
 
 
506 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  25.96 
 
 
492 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  26.61 
 
 
494 aa  120  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.33 
 
 
492 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  25.86 
 
 
489 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.74 
 
 
491 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.46 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.33 
 
 
493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.33 
 
 
493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.33 
 
 
493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.33 
 
 
492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.33 
 
 
492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  25.57 
 
 
492 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.62 
 
 
483 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  27.68 
 
 
499 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>