More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  71.27 
 
 		 562 aa  697    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  100 
 
 		 591 aa  1129    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  56.73 
 
 		 551 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  49.73 
 
 		 546 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  46.61 
 
 		 580 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  46.35 
 
 		 575 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  49.37 
 
 		 546 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  47.01 
 
 		 580 aa  388  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  47.19 
 
 		 580 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  47.03 
 
 		 614 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  44.31 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  46.98 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  46.98 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  46.98 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  44.23 
 
 		 573 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  46.77 
 
 		 580 aa  361  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  45.05 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  39.18 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  48.41 
 
 		 499 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  48.36 
 
 		 492 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  45.81 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  45.42 
 
 		 488 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  28.25 
 
 		 637 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  31.57 
 
 		 590 aa  178  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  29.41 
 
 		 552 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  40.66 
 
 		 498 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  35.61 
 
 		 693 aa  177  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  30.06 
 
 		 551 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  30.93 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  29.68 
 
 		 551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  29.44 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  29.87 
 
 		 552 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  29.79 
 
 		 552 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  29.98 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  29.34 
 
 		 554 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  28.77 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  28 
 
 		 548 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  28.97 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  28.77 
 
 		 516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  28.57 
 
 		 516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  28.57 
 
 		 516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  28.57 
 
 		 516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  28.77 
 
 		 516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  28.65 
 
 		 554 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  28.51 
 
 		 516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  29.72 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  28.37 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  31.04 
 
 		 515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  28.31 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  29.42 
 
 		 549 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  29.42 
 
 		 549 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.8 
 
 		 516 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  29.42 
 
 		 549 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  29.42 
 
 		 549 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  29.15 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  29.47 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  29.47 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.36 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  29.47 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  29.08 
 
 		 552 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.53 
 
 		 659 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  29.19 
 
 		 571 aa  157  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.85 
 
 		 570 aa  157  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.2 
 
 		 671 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.36 
 
 		 671 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  29.36 
 
 		 671 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  29.88 
 
 		 576 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  29.36 
 
 		 671 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  27.48 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  29.11 
 
 		 549 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.36 
 
 		 671 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  29.45 
 
 		 807 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  29.17 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  29.17 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  28.46 
 
 		 584 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  28.31 
 
 		 546 aa  153  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  27.94 
 
 		 665 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  28.4 
 
 		 584 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  29.76 
 
 		 687 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.29 
 
 		 671 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.62 
 
 		 575 aa  150  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.32 
 
 		 672 aa  150  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  27.21 
 
 		 678 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  27.69 
 
 		 576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  28.75 
 
 		 688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  27.69 
 
 		 576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  28.5 
 
 		 671 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  28.86 
 
 		 572 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  30.25 
 
 		 506 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  27.43 
 
 		 574 aa  147  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  29.6 
 
 		 687 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  28.66 
 
 		 584 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  28.49 
 
 		 726 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  29.35 
 
 		 665 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  28.82 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  29.36 
 
 		 584 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  26.98 
 
 		 703 aa  143  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  27.94 
 
 		 520 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  28.19 
 
 		 713 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  28.7 
 
 		 703 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>