More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  100 
 
 		 579 aa  1139    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  55.69 
 
 		 603 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  48.56 
 
 		 580 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  48.19 
 
 		 580 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  47.01 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  48.56 
 
 		 578 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  48.56 
 
 		 578 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  48.56 
 
 		 578 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  47.2 
 
 		 580 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  48.02 
 
 		 580 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  46.22 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  47.55 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  49.12 
 
 		 546 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  42.21 
 
 		 562 aa  345  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  40.28 
 
 		 591 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  40.14 
 
 		 551 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  42.55 
 
 		 614 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  51.23 
 
 		 499 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  49.31 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  46.74 
 
 		 498 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  47.24 
 
 		 492 aa  216  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  45.23 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  35.86 
 
 		 693 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  48.93 
 
 		 495 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  26.75 
 
 		 584 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 584 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  27 
 
 		 554 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  26.73 
 
 		 584 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  27.18 
 
 		 554 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.09 
 
 		 659 aa  150  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  26.73 
 
 		 516 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  26.66 
 
 		 554 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.93 
 
 		 516 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  26.53 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  26.34 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  26.53 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  26.53 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  26.53 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  26.6 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  26.53 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.53 
 
 		 516 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  26.14 
 
 		 516 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  27.16 
 
 		 590 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  26.34 
 
 		 516 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  26.26 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  25.99 
 
 		 665 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  25.54 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  26.4 
 
 		 584 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0272  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.41 
 
 		 536 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00870047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.42 
 
 		 518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  27.29 
 
 		 637 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  25.89 
 
 		 687 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  26.94 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  28.07 
 
 		 664 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  27.24 
 
 		 657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  26.75 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  27.41 
 
 		 671 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.41 
 
 		 671 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  27.61 
 
 		 807 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  27.41 
 
 		 671 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.41 
 
 		 671 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  26.57 
 
 		 520 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  27.49 
 
 		 665 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.41 
 
 		 671 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.41 
 
 		 671 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  25.57 
 
 		 687 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  27.24 
 
 		 659 aa  130  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.75 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  26.82 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  26.32 
 
 		 572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  26.63 
 
 		 671 aa  128  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  25.17 
 
 		 559 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  25.24 
 
 		 566 aa  127  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  26.49 
 
 		 576 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  25.39 
 
 		 576 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  25.39 
 
 		 576 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  26.91 
 
 		 683 aa  124  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  25.68 
 
 		 688 aa  123  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  27.69 
 
 		 661 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.94 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.34 
 
 		 577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  27.4 
 
 		 528 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  26.09 
 
 		 557 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  27.09 
 
 		 662 aa  120  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  25.22 
 
 		 666 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  27.08 
 
 		 538 aa  120  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.88 
 
 		 538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  25.96 
 
 		 543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  26.92 
 
 		 532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  26.42 
 
 		 560 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25230  acetate permease  26.33 
 
 		 554 aa  117  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.87 
 
 		 672 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35920  acetate permease  25.74 
 
 		 552 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00568012  hitchhiker  5.12973e-17 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  26.82 
 
 		 671 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  25.16 
 
 		 683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 671 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 671 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 671 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  26.25 
 
 		 556 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  25.57 
 
 		 506 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>