More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0697 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  100 
 
 		 580 aa  1105    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  74.78 
 
 		 580 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  74.59 
 
 		 578 aa  749    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  74.59 
 
 		 578 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  74.64 
 
 		 580 aa  763    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  74.59 
 
 		 578 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  53.28 
 
 		 603 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  54.08 
 
 		 580 aa  500  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  53.15 
 
 		 575 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  52.29 
 
 		 546 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  53.52 
 
 		 546 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  52.77 
 
 		 573 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  46.42 
 
 		 579 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  46.31 
 
 		 591 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  46.36 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  44.94 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  48.46 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  55.31 
 
 		 499 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  66.19 
 
 		 505 aa  256  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  53.76 
 
 		 498 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  52.3 
 
 		 492 aa  249  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  52.83 
 
 		 488 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  53.19 
 
 		 495 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  53.77 
 
 		 693 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  33.46 
 
 		 590 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  30.74 
 
 		 665 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  29.54 
 
 		 584 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.15 
 
 		 659 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  29.2 
 
 		 584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  29.23 
 
 		 513 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  28.8 
 
 		 584 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  29.34 
 
 		 661 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  32.05 
 
 		 659 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  31.66 
 
 		 657 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  30.92 
 
 		 665 aa  177  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  29.98 
 
 		 553 aa  177  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  29.34 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  28.55 
 
 		 662 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  29.47 
 
 		 661 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  30.2 
 
 		 664 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  29.55 
 
 		 576 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  28.4 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  28.02 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  28.02 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  28.4 
 
 		 541 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.77 
 
 		 539 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.57 
 
 		 541 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  26.17 
 
 		 577 aa  169  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  32.83 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  28.43 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  28.84 
 
 		 574 aa  164  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  30 
 
 		 552 aa  163  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  28.03 
 
 		 577 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.94 
 
 		 655 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  27.51 
 
 		 552 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  29.01 
 
 		 571 aa  161  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  32.17 
 
 		 536 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  28.37 
 
 		 552 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  27.43 
 
 		 572 aa  160  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  28.83 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  28.35 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.65 
 
 		 577 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  28.08 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  31.75 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  28.91 
 
 		 574 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  29.03 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  27.83 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  28.28 
 
 		 551 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.24 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.43 
 
 		 575 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.56 
 
 		 541 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.56 
 
 		 541 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.56 
 
 		 541 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  30.46 
 
 		 637 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  31.02 
 
 		 543 aa  153  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  32.32 
 
 		 532 aa  150  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.76 
 
 		 543 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  30.59 
 
 		 546 aa  150  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  25.62 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  29.53 
 
 		 556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  28.6 
 
 		 509 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  28.34 
 
 		 520 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  27.4 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  28.13 
 
 		 520 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  28.13 
 
 		 520 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.23 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.68 
 
 		 534 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3489  acetate permease  28.52 
 
 		 560 aa  143  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2738  sodium/solute symporter  27.97 
 
 		 523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640061  normal  0.0448149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 573 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.62 
 
 		 563 aa  140  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5644  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 545 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0986  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.89 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  27.16 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  28.03 
 
 		 688 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 687 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.93 
 
 		 672 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  27.26 
 
 		 683 aa  130  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  26.58 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  29.29 
 
 		 672 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>