More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1155 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  100 
 
 
495 aa  937    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  54.12 
 
 
499 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  54.07 
 
 
498 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  54.7 
 
 
488 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  53.35 
 
 
546 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  54.56 
 
 
492 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  53.47 
 
 
505 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  52.97 
 
 
546 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  45.05 
 
 
591 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.28 
 
 
518 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  73.41 
 
 
578 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  73.41 
 
 
578 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  73.41 
 
 
578 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  71.59 
 
 
580 aa  246  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  71.68 
 
 
580 aa  243  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  68.39 
 
 
580 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  63.54 
 
 
603 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  55.81 
 
 
575 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  65.79 
 
 
580 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  65.54 
 
 
573 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  31.37 
 
 
513 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  52.36 
 
 
551 aa  199  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  45.06 
 
 
693 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  31.54 
 
 
511 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  51.53 
 
 
579 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  56.61 
 
 
562 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.45 
 
 
530 aa  177  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  31.15 
 
 
516 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.59 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.07 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  30.3 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  30.93 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  30.93 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.91 
 
 
659 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  30.93 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  30.07 
 
 
516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.93 
 
 
516 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  60.12 
 
 
614 aa  174  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  29.92 
 
 
577 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  30.7 
 
 
516 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.11 
 
 
560 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  29.84 
 
 
516 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  31.33 
 
 
513 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  29.59 
 
 
584 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.24 
 
 
539 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.89 
 
 
516 aa  170  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  29.09 
 
 
661 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  32.1 
 
 
519 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  30.35 
 
 
515 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  31.09 
 
 
554 aa  169  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  30.09 
 
 
584 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  31.19 
 
 
559 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  29.18 
 
 
665 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  31.15 
 
 
564 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  29.53 
 
 
584 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  29.71 
 
 
553 aa  166  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  28.87 
 
 
548 aa  166  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  29.56 
 
 
563 aa  166  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.94 
 
 
554 aa  166  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  30.43 
 
 
541 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  30.96 
 
 
561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  30.96 
 
 
561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  30.96 
 
 
561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  28.94 
 
 
659 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  30.74 
 
 
541 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  32.11 
 
 
561 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  31.4 
 
 
561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.4 
 
 
561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  27.83 
 
 
552 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  31.7 
 
 
563 aa  163  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  31.7 
 
 
563 aa  163  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.23 
 
 
541 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  30.97 
 
 
665 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  30.77 
 
 
561 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  28.94 
 
 
657 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  30.96 
 
 
561 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0429  acetate permease  31.35 
 
 
561 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.839337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  30.92 
 
 
664 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  34.26 
 
 
554 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  28.28 
 
 
554 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  27.43 
 
 
552 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  28.03 
 
 
552 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  29.8 
 
 
546 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  28.28 
 
 
554 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  27.87 
 
 
554 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  28.72 
 
 
550 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  28.48 
 
 
554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  31.28 
 
 
584 aa  156  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  28.6 
 
 
666 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  27.13 
 
 
537 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  26.97 
 
 
551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  27.17 
 
 
551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.61 
 
 
563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  29.23 
 
 
554 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3229  acetate permease  30.71 
 
 
571 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2814  acetate permease  30.71 
 
 
571 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0205  acetate permease  30.71 
 
 
571 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1388  acetate permease  30.71 
 
 
571 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  27.34 
 
 
551 aa  153  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  30.5 
 
 
528 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>