More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1373 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  84.55 
 
 		 488 aa  765    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  100 
 
 		 498 aa  957    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  57.76 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  59.06 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  58.26 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  52.28 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  52.03 
 
 		 546 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  54.07 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.96 
 
 		 518 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  56.29 
 
 		 580 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  60.92 
 
 		 575 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  60.56 
 
 		 573 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  67.63 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  67.63 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  67.63 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  66.85 
 
 		 580 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  66.85 
 
 		 580 aa  230  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  69.61 
 
 		 580 aa  226  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  49.82 
 
 		 603 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  34.1 
 
 		 515 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  34.99 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.66 
 
 		 515 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  52.97 
 
 		 579 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.52 
 
 		 554 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  31.91 
 
 		 513 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.79 
 
 		 539 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.74 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  32.94 
 
 		 559 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  34.17 
 
 		 554 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  31.55 
 
 		 541 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  30.95 
 
 		 541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  47.89 
 
 		 551 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  52.53 
 
 		 562 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.57 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  45.67 
 
 		 614 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  30.34 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  51.89 
 
 		 591 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  31.89 
 
 		 511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  30.34 
 
 		 516 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.34 
 
 		 516 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  33.87 
 
 		 513 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  30.34 
 
 		 516 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.9 
 
 		 659 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  30.34 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  30.34 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  30.34 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  30.34 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  31.44 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  32.2 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  28.36 
 
 		 661 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.11 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  34.16 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  32.34 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  31.97 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  30.62 
 
 		 577 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  32.11 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.08 
 
 		 560 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.87 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  30.98 
 
 		 552 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  26.99 
 
 		 665 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  48.97 
 
 		 693 aa  177  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  29.39 
 
 		 548 aa  177  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  30.98 
 
 		 554 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  30.98 
 
 		 554 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  30.98 
 
 		 554 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.16 
 
 		 563 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  31.87 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  27.55 
 
 		 584 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.25 
 
 		 516 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0429  acetate permease  31.35 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.839337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  31.14 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  30.08 
 
 		 666 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  26.02 
 
 		 584 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  30.82 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  30.82 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1898  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.81 
 
 		 514 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  30.82 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  32.17 
 
 		 563 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  31.05 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  32.17 
 
 		 563 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  32.36 
 
 		 563 aa  170  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  27.33 
 
 		 584 aa  170  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  29.29 
 
 		 537 aa  170  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  31.5 
 
 		 561 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  31.5 
 
 		 561 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  31.5 
 
 		 561 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  30.92 
 
 		 551 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  30.5 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  30.69 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2797  acetate permease  30.34 
 
 		 552 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  30.75 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  32.11 
 
 		 561 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  30.28 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  28.54 
 
 		 584 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.26 
 
 		 561 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  31.26 
 
 		 561 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  30.57 
 
 		 576 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  30.57 
 
 		 576 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  31.21 
 
 		 546 aa  166  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35920  acetate permease  30.3 
 
 		 552 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00568012  hitchhiker  5.12973e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>