More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4497 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  100 
 
 		 546 aa  1040    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  91.58 
 
 		 546 aa  903    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  59.71 
 
 		 580 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  59.63 
 
 		 499 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  60.39 
 
 		 575 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  57.89 
 
 		 573 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  57.77 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  57.43 
 
 		 580 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  56.12 
 
 		 603 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  56.93 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  56.93 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  54.18 
 
 		 505 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  56.93 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  57.45 
 
 		 580 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  54.38 
 
 		 580 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  53.7 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  52.03 
 
 		 498 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  49.37 
 
 		 591 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  50.27 
 
 		 551 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  49.63 
 
 		 562 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  52.97 
 
 		 495 aa  412  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  51.44 
 
 		 614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  47.63 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  40.65 
 
 		 693 aa  219  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  30.95 
 
 		 513 aa  190  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  29.54 
 
 		 665 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  28.63 
 
 		 584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  28.27 
 
 		 584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  29.61 
 
 		 559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.67 
 
 		 659 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  31.88 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  28.62 
 
 		 661 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  28.12 
 
 		 584 aa  179  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  29.48 
 
 		 563 aa  177  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  29.66 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  31.09 
 
 		 561 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.09 
 
 		 561 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  28.52 
 
 		 577 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.34 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  31.07 
 
 		 515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  30.34 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  29.51 
 
 		 553 aa  174  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.15 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.02 
 
 		 560 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  30.15 
 
 		 516 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  30.15 
 
 		 516 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  30.15 
 
 		 516 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  29.37 
 
 		 659 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  30.15 
 
 		 516 aa  173  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  30.15 
 
 		 516 aa  173  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  29.88 
 
 		 665 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.9 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.8 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  29.42 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  29.9 
 
 		 657 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  30.95 
 
 		 519 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  29.96 
 
 		 516 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  31.19 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  32.04 
 
 		 563 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  32.04 
 
 		 563 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  31.58 
 
 		 564 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.08 
 
 		 530 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  28.98 
 
 		 554 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  28.98 
 
 		 554 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  28.08 
 
 		 584 aa  170  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  29.01 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.88 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  31.51 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  31.51 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  31.51 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  30.47 
 
 		 541 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  28.8 
 
 		 554 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  28.07 
 
 		 552 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  29.98 
 
 		 664 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  29.24 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  28.37 
 
 		 548 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  32.82 
 
 		 554 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.89 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0429  acetate permease  31.02 
 
 		 561 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.839337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  30.47 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.93 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.8 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  29.22 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  28.68 
 
 		 551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  28.49 
 
 		 551 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  30.61 
 
 		 544 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35030  cation/acetate symporter ActP  29.45 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.89065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  28.06 
 
 		 637 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  31.06 
 
 		 566 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  30.73 
 
 		 561 aa  160  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  28.79 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  31.06 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  30.63 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  29.24 
 
 		 573 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  30.08 
 
 		 561 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  28.68 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  30.04 
 
 		 552 aa  156  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  29.2 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  29.3 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  29.46 
 
 		 577 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>