More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2141 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  100 
 
 
580 aa  1111    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  83.91 
 
 
578 aa  825    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  83.91 
 
 
578 aa  825    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  83.91 
 
 
578 aa  825    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  92.59 
 
 
580 aa  961    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  74.82 
 
 
580 aa  742    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  53.25 
 
 
580 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  52.89 
 
 
603 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  57.02 
 
 
546 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  55.3 
 
 
575 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  57.02 
 
 
546 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  52.77 
 
 
573 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  47.11 
 
 
591 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  47.94 
 
 
551 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  48.75 
 
 
614 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  47.83 
 
 
579 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  45.11 
 
 
562 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  55.11 
 
 
499 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  51.54 
 
 
498 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  62.09 
 
 
505 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  51.54 
 
 
492 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  53.76 
 
 
488 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  68.56 
 
 
495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  54.12 
 
 
693 aa  207  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  31.37 
 
 
665 aa  186  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.66 
 
 
659 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  30.92 
 
 
584 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  31.69 
 
 
590 aa  170  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.52 
 
 
530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  31.51 
 
 
665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  31.51 
 
 
664 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.61 
 
 
518 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  28.1 
 
 
541 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  27.18 
 
 
537 aa  158  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  27.9 
 
 
576 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  27.9 
 
 
576 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  27.93 
 
 
576 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  27.71 
 
 
572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  28.93 
 
 
576 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  28.29 
 
 
576 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.73 
 
 
575 aa  146  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.37 
 
 
543 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  28.17 
 
 
637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  29.68 
 
 
543 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  27.62 
 
 
586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  27.07 
 
 
541 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  27.72 
 
 
574 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  27.67 
 
 
566 aa  135  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3489  acetate permease  26.85 
 
 
560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  25.08 
 
 
573 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  26.36 
 
 
574 aa  128  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.02 
 
 
672 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  29.04 
 
 
683 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  25.46 
 
 
568 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  29.09 
 
 
551 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0272  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.76 
 
 
536 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00870047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  28.8 
 
 
672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  29.35 
 
 
672 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  41.72 
 
 
513 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  28.55 
 
 
671 aa  120  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  27.94 
 
 
807 aa  120  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  29.61 
 
 
671 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.61 
 
 
671 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  29.61 
 
 
671 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.61 
 
 
671 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  31.34 
 
 
591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  29.04 
 
 
593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.97 
 
 
671 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  24.58 
 
 
572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.5 
 
 
671 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  29.73 
 
 
578 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  30.03 
 
 
578 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  30.03 
 
 
578 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  29.14 
 
 
719 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  29.43 
 
 
578 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  38.15 
 
 
584 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  27.08 
 
 
683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  29.13 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.46 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  38.55 
 
 
662 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  37.85 
 
 
661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  31.48 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  29.13 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  38.55 
 
 
661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  29.13 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  30.33 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  29.13 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  28.37 
 
 
722 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  25.08 
 
 
678 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  27.35 
 
 
722 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  27.06 
 
 
687 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  27.39 
 
 
687 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  37.79 
 
 
584 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.24 
 
 
582 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  30.86 
 
 
582 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  24.83 
 
 
572 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  27.54 
 
 
671 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  26.96 
 
 
688 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  27.25 
 
 
592 aa  113  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  31.16 
 
 
619 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>