More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2382 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  100 
 
 		 528 aa  1021    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  45.42 
 
 		 515 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.09 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  44.57 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  43.66 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.33 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  43.33 
 
 		 516 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  43.14 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  43.14 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  43.14 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  43.33 
 
 		 516 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  43.14 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  43.33 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  43.33 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  42.94 
 
 		 516 aa  415  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.35 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.32 
 
 		 530 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  42.02 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  42.56 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  41.32 
 
 		 551 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.41 
 
 		 539 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  43.05 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.05 
 
 		 541 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  41.32 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  43.24 
 
 		 541 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  40.72 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  42.59 
 
 		 553 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  39.96 
 
 		 554 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  40.94 
 
 		 552 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  41.83 
 
 		 559 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5152  SSS sodium solute transporter superfamily  44.81 
 
 		 516 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.13 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  39.96 
 
 		 554 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  42.77 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  40 
 
 		 552 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  41.79 
 
 		 552 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  40.19 
 
 		 552 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  43.39 
 
 		 536 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  39.85 
 
 		 554 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  43.92 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  40.26 
 
 		 550 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  41.25 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  42.81 
 
 		 568 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  39.77 
 
 		 554 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  39.25 
 
 		 551 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  44.05 
 
 		 537 aa  382  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  39.25 
 
 		 551 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  41.71 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  41.67 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.48 
 
 		 659 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.54 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  39.43 
 
 		 551 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.38 
 
 		 534 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  38.24 
 
 		 584 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  37.54 
 
 		 584 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.19 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  39.27 
 
 		 577 aa  379  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.36 
 
 		 557 aa  379  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  40.83 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  42.31 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  40.84 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  40.64 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  40.64 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  38.06 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  40.83 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  40.83 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  40.64 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  40.64 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  41.68 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  40.83 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  40.65 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  40.82 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  40.83 
 
 		 549 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  40.64 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  40.65 
 
 		 520 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  40.83 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  41.57 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  41.98 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  41.03 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  40.64 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  40.64 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  37.89 
 
 		 584 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.67 
 
 		 508 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.67 
 
 		 508 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  39.74 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  39.74 
 
 		 561 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  39.74 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  39.45 
 
 		 561 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  39.27 
 
 		 561 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  41.04 
 
 		 549 aa  363  6e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  40 
 
 		 666 aa  359  8e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  40.15 
 
 		 557 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  35.01 
 
 		 661 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  38.42 
 
 		 576 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  38.42 
 
 		 576 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0429  acetate permease  39.45 
 
 		 561 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.839337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  40.04 
 
 		 554 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  39.24 
 
 		 553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  37.33 
 
 		 665 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3743  acetate permease  41.49 
 
 		 554 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>