More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5152 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.9 
 
 		 508 aa  661    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.9 
 
 		 508 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5152  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 516 aa  1011    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  47.93 
 
 		 515 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.67 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.47 
 
 		 539 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  46.51 
 
 		 513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  47.31 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.62 
 
 		 659 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  44.76 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  44.76 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.56 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  45.56 
 
 		 541 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  44.76 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  45.56 
 
 		 541 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  44.85 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.34 
 
 		 515 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  46 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  44.76 
 
 		 516 aa  432  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  44.76 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  44.95 
 
 		 516 aa  432  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.76 
 
 		 516 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  44.76 
 
 		 516 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  44.76 
 
 		 516 aa  432  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  40.55 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  40.9 
 
 		 584 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.47 
 
 		 516 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  40.73 
 
 		 584 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  45.65 
 
 		 584 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  39.28 
 
 		 665 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  40.69 
 
 		 665 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  41.03 
 
 		 664 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  42.19 
 
 		 657 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3288  Na+/solute symporter  42.56 
 
 		 655 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  43.1 
 
 		 554 aa  412  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  45.16 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  46.5 
 
 		 659 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  43.79 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  47.87 
 
 		 662 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  38.66 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  47.66 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.23 
 
 		 655 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  44.12 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  43.5 
 
 		 554 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  44.12 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  43.93 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  44.12 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  43.3 
 
 		 554 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  44.81 
 
 		 528 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  42.52 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  42.31 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  42.5 
 
 		 552 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  43.11 
 
 		 554 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  41.75 
 
 		 552 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.52 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  44.28 
 
 		 561 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  44.08 
 
 		 568 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  42.72 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  41.73 
 
 		 551 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  41.56 
 
 		 552 aa  392  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  43.47 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  41.73 
 
 		 551 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  42.33 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  42.33 
 
 		 552 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  43.47 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  43.47 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  43.47 
 
 		 549 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  41.73 
 
 		 551 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  43.47 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  42.91 
 
 		 554 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  43.27 
 
 		 549 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.55 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  41.83 
 
 		 551 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  43.27 
 
 		 549 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.73 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.51 
 
 		 524 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  41.95 
 
 		 553 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  43.27 
 
 		 549 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  41.83 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  43.27 
 
 		 549 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  43.27 
 
 		 549 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  43.08 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  43.08 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  43.88 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3743  acetate permease  43.95 
 
 		 554 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  43.08 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.28 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  43.08 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  46 
 
 		 536 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  44.7 
 
 		 563 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.41 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.88 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  44.3 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  42.45 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  44.7 
 
 		 563 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  42.11 
 
 		 563 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  43.83 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1314  SSS sodium solute transporter superfamily  42.64 
 
 		 522 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  43.44 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  41.86 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>